Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Ighv1-30-201ENSMUST00000194082 349 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm31305-201ENSMUST00000198557 710 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 2010309G21Rik-201ENSMUST00000198927 458 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm43550-201ENSMUST00000200597 303 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm44196-202ENSMUST00000204186 812 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm32052-201ENSMUST00000212073 799 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 AC121793.1-201ENSMUST00000214211 633 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 AC121997.2-202ENSMUST00000227158 939 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Clec4n-201ENSMUST00000024118 1229 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Scp2d1-201ENSMUST00000028918 760 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Klrk1-201ENSMUST00000032252 1270 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm5250-201ENSMUST00000059065 321 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Cldn10-202ENSMUST00000071546 1031 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Olfr23-201ENSMUST00000092917 978 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Adcy10-203ENSMUST00000111440 5078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Il1rl1-201ENSMUST00000053043 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Spire1-201ENSMUST00000045105 5033 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Hydin-201ENSMUST00000043141 15783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Stag2-203ENSMUST00000115073 6171 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Ppfibp2-202ENSMUST00000098134 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Aph1c-202ENSMUST00000169282 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Mug-ps1-202ENSMUST00000189975 3293 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm12022-201ENSMUST00000143311 1340 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm8177-201ENSMUST00000181591 1336 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm18726-201ENSMUST00000218175 2010 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Uba1y-202ENSMUST00000190013 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gtf2h1-202ENSMUST00000107644 2187 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
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Usp39Q3TIX9 AC122356.1-202ENSMUST00000227328 2758 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Masp1-201ENSMUST00000089883 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
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Usp39Q3TIX9 Zc4h2-201ENSMUST00000044382 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Cped1-202ENSMUST00000115383 5690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Ank3-240ENSMUST00000183169 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
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Usp39Q3TIX9 Mrpl1-202ENSMUST00000117766 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Trim43c-202ENSMUST00000186363 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gpatch11-201ENSMUST00000170759 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm42744-201ENSMUST00000196517 2147 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Tlr1-202ENSMUST00000197315 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
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Usp39Q3TIX9 Gm15731-201ENSMUST00000146887 2195 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm15200-201ENSMUST00000149950 410 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
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Usp39Q3TIX9 2010308F09Rik-202ENSMUST00000186931 578 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm20917-202ENSMUST00000188706 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
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Usp39Q3TIX9 1700025K24Rik-201ENSMUST00000190635 740 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
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Usp39Q3TIX9 Ccl20-201ENSMUST00000027351 1417 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Olfr905-201ENSMUST00000051111 937 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Slx-201ENSMUST00000096913 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm13304-201ENSMUST00000098123 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Oxsm-203ENSMUST00000112625 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Olfr976-201ENSMUST00000169307 2813 ntAPPRIS P2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gbp3-202ENSMUST00000106221 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm45201-201ENSMUST00000207187 2679 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 9330182O14Rik-202ENSMUST00000228780 2053 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm43168-201ENSMUST00000201039 1612 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Cep192-201ENSMUST00000025425 8093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 4930590J08Rik-203ENSMUST00000205686 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm43515-201ENSMUST00000197930 2141 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Ate1-208ENSMUST00000216011 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Pira2-202ENSMUST00000119469 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm44553-201ENSMUST00000206316 2037 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm11855-201ENSMUST00000121562 1869 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Magea5-202ENSMUST00000169540 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm9573-201ENSMUST00000164502 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm43181-201ENSMUST00000197001 2072 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Vmn2r15-201ENSMUST00000167133 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Mapk8-205ENSMUST00000111945 5756 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 Gm7978-201ENSMUST00000178552 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Usp39Q3TIX9 AC166574.5-201ENSMUST00000227438 1432 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
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