Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Slc25a40-202ENSMUST00000170496 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Gm27179-201ENSMUST00000184652 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Dst-209ENSMUST00000182697 2704 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Ttc21b-202ENSMUST00000125446 4061 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Zfp655-205ENSMUST00000199322 4157 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Pknox1-201ENSMUST00000097352 4172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Gm43496-201ENSMUST00000201682 3001 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Bnip3l-201ENSMUST00000022634 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Gm23748-201ENSMUST00000104227 131 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Gm15502-201ENSMUST00000121449 208 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Gm12754-201ENSMUST00000121908 454 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Scgb2b23-ps-201ENSMUST00000122094 330 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Gm25550-201ENSMUST00000158079 128 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Gm37502-201ENSMUST00000192981 356 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Gm10416-201ENSMUST00000197379 645 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Gm30708-201ENSMUST00000202183 312 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Gm45334-201ENSMUST00000211118 1227 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Gm26130-201ENSMUST00000083171 138 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Cbx3-ps4-201ENSMUST00000091531 549 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Slc37a3-201ENSMUST00000090243 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Bbx-208ENSMUST00000138166 8743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Irgm1-201ENSMUST00000049519 2259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Trpm8-201ENSMUST00000040210 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Cdc42bpa-203ENSMUST00000097453 6704 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Kcnab1-201ENSMUST00000049230 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Zfp827-202ENSMUST00000098614 7581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Gm16344-201ENSMUST00000150084 1567 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Map2-204ENSMUST00000114013 6258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Med1-203ENSMUST00000107545 8024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Pkn2-210ENSMUST00000174422 2904 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Mapk10-205ENSMUST00000128869 2518 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Dock9-206ENSMUST00000212181 7368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Gm11217-201ENSMUST00000141162 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Qrich2-204ENSMUST00000208602 7260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Gm34121-201ENSMUST00000206188 1490 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Sirpb1b-201ENSMUST00000091319 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Olfr971-202ENSMUST00000214242 2027 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Pcsk2os1-201ENSMUST00000126735 4233 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Gm26422-201ENSMUST00000104276 132 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Gm11256-201ENSMUST00000118109 829 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Clec4e-207ENSMUST00000177367 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Gm27010-201ENSMUST00000182727 863 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cux1P53564 0610031O16Rik-204ENSMUST00000185122 825 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Olfr374-201ENSMUST00000209675 1053 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cux1P53564 AC156016.2-201ENSMUST00000228200 525 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Vwde-202ENSMUST00000203074 5626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Rbm12-201ENSMUST00000059647 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Olfr1426-205ENSMUST00000219155 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Gm42577-201ENSMUST00000201367 3211 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Ctnna2-202ENSMUST00000159626 3908 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Mtpap-201ENSMUST00000025077 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Fbln5-201ENSMUST00000021603 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Gm16025-202ENSMUST00000161923 2425 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Gm30329-201ENSMUST00000211572 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cux1P53564 AC164623.1-201ENSMUST00000217947 2709 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Afap1l2-201ENSMUST00000111584 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cux1P53564 F2rl2-201ENSMUST00000022182 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Stat2-201ENSMUST00000085708 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Gm2762-207ENSMUST00000202739 2665 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Ank1-213ENSMUST00000141784 6566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Gm13619-201ENSMUST00000155722 2138 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Zfp661-201ENSMUST00000077422 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cux1P53564 5033428I22Rik-204ENSMUST00000210633 6652 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Gm13006-201ENSMUST00000118683 214 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Gm15712-201ENSMUST00000120369 1156 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Gm20490-201ENSMUST00000173622 198 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Gm27152-201ENSMUST00000183828 99 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cux1P53564 1700028E10Rik-204ENSMUST00000201853 767 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cux1P53564 1700013A02Rik-201ENSMUST00000202969 645 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Gm45448-201ENSMUST00000211739 209 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Gm9535-201ENSMUST00000218499 768 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cux1P53564 A330049N07Rik-202ENSMUST00000219920 587 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cux1P53564 AC137902.1-201ENSMUST00000228184 102 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Gm10037-201ENSMUST00000060609 315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Tas2r144-201ENSMUST00000063489 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Olfr687-201ENSMUST00000098154 938 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Cep57l1-209ENSMUST00000189770 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Gm10513-201ENSMUST00000194203 6468 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Cnot2-210ENSMUST00000168036 2693 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Unc5c-204ENSMUST00000130636 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Prps2-201ENSMUST00000026839 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Fgf1-201ENSMUST00000040647 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Csde1-216ENSMUST00000199571 3123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Adgre1-202ENSMUST00000086763 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Lhfpl2-204ENSMUST00000121618 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Tenm4-201ENSMUST00000107162 11021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Fblim1-201ENSMUST00000006381 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Gm24473-201ENSMUST00000104483 131 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cux1P53564 Gm7008-203ENSMUST00000171356 476 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cux1P53564 Gm17096-201ENSMUST00000172037 733 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cux1P53564 Gm17048-201ENSMUST00000179266 847 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cux1P53564 Gm38237-201ENSMUST00000193366 376 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cux1P53564 Gm45064-201ENSMUST00000208619 443 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cux1P53564 Gm17849-201ENSMUST00000219788 853 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cux1P53564 AC123656.1-201ENSMUST00000227121 581 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cux1P53564 Prl3d3-201ENSMUST00000073601 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cux1P53564 Calcoco2-202ENSMUST00000097162 968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cux1P53564 Nrk-201ENSMUST00000064937 6604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cux1P53564 Skp2-202ENSMUST00000110585 6185 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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