Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm44621-201ENSMUST00000207643 1166 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
VdrP48281 4930465I24Rik-201ENSMUST00000209697 426 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
VdrP48281 Axdnd1-210ENSMUST00000212747 1238 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm19810-201ENSMUST00000218521 251 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm10451-202ENSMUST00000219367 855 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
VdrP48281 Cinp-205ENSMUST00000221182 774 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
VdrP48281 AC147256.1-201ENSMUST00000221589 626 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm32300-201ENSMUST00000221735 515 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm26571-203ENSMUST00000221865 555 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
VdrP48281 AC139323.1-201ENSMUST00000223370 1040 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
VdrP48281 AC154767.1-201ENSMUST00000224669 358 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
VdrP48281 AC158981.1-201ENSMUST00000226943 1205 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
VdrP48281 Spp2-201ENSMUST00000027518 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
VdrP48281 Olfr125-201ENSMUST00000050255 1118 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
VdrP48281 Olfr479-201ENSMUST00000063151 1111 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
VdrP48281 Vmn1r12-201ENSMUST00000073384 924 ntAPPRIS P2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
VdrP48281 Olfr412-201ENSMUST00000077794 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
VdrP48281 Olfr1286-201ENSMUST00000099617 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
VdrP48281 2310015K22Rik-201ENSMUST00000191452 1461 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gje1-201ENSMUST00000020016 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
VdrP48281 Nxt2-204ENSMUST00000112916 2532 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
VdrP48281 Vmn1r54-202ENSMUST00000226921 3234 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
VdrP48281 Dgkb-201ENSMUST00000040500 6373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm44850-201ENSMUST00000205621 1329 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
VdrP48281 Recql5-201ENSMUST00000021097 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
VdrP48281 Olfr766-ps1-201ENSMUST00000204515 2909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
VdrP48281 Usp8-202ENSMUST00000110416 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
VdrP48281 Smc1b-201ENSMUST00000023068 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gucy1a3-201ENSMUST00000048976 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
VdrP48281 Blm-201ENSMUST00000081314 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm43788-201ENSMUST00000201539 2417 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
VdrP48281 AC154630.1-201ENSMUST00000215334 2440 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm44550-201ENSMUST00000207311 2058 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm45805-201ENSMUST00000212695 2066 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
VdrP48281 Asic5-202ENSMUST00000107736 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
VdrP48281 Actr6-201ENSMUST00000020109 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
VdrP48281 Phlpp2-201ENSMUST00000034175 7839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
VdrP48281 Icos-202ENSMUST00000102827 3241 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
VdrP48281 Sh3kbp1-205ENSMUST00000112453 2515 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
VdrP48281 Wdfy4-201ENSMUST00000061753 9681 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
VdrP48281 Olfr78-202ENSMUST00000168007 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
VdrP48281 Enpp4-202ENSMUST00000143137 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm13106-201ENSMUST00000119045 1443 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
VdrP48281 Olfr1480-202ENSMUST00000207093 1819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
VdrP48281 Eif4g2-213ENSMUST00000162415 7995 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
VdrP48281 Kcnb2-202ENSMUST00000175681 3963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm24938-201ENSMUST00000102225 110 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
VdrP48281 Hmgn2-202ENSMUST00000102552 676 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
VdrP48281 Mup1-202ENSMUST00000103012 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm25803-201ENSMUST00000104419 131 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
VdrP48281 Mup16-202ENSMUST00000107483 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
VdrP48281 Mup17-201ENSMUST00000107484 927 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm14561-201ENSMUST00000117376 798 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm12959-201ENSMUST00000119396 403 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
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VdrP48281 Gm15885-201ENSMUST00000122114 388 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
VdrP48281 n-R5s76-201ENSMUST00000122700 113 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
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VdrP48281 Rpl21-ps8-201ENSMUST00000130005 478 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm15522-201ENSMUST00000134467 785 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
VdrP48281 Cyp3a25-202ENSMUST00000138870 513 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
VdrP48281 4930599N23Rik-201ENSMUST00000146981 880 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm15286-201ENSMUST00000150623 743 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
VdrP48281 1700025N21Rik-201ENSMUST00000160997 686 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
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VdrP48281 Gm43518-201ENSMUST00000166129 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm17059-201ENSMUST00000168284 519 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm17235-201ENSMUST00000169128 964 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
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VdrP48281 Gm20257-201ENSMUST00000185352 936 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
VdrP48281 Nabp1-206ENSMUST00000188051 680 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm37581-201ENSMUST00000192371 988 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
VdrP48281 5430433H01Rik-201ENSMUST00000193978 542 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
VdrP48281 Traj59-202ENSMUST00000197589 62 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm42775-201ENSMUST00000198407 740 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm43732-201ENSMUST00000200260 511 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm2762-205ENSMUST00000202366 356 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
VdrP48281 Cnot2-201ENSMUST00000020374 1059 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm45350-201ENSMUST00000210560 509 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
VdrP48281 5830408C22Rik-203ENSMUST00000210596 326 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
VdrP48281 CT009748.2-201ENSMUST00000213828 1082 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm19709-201ENSMUST00000215403 482 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm21941-201ENSMUST00000221121 562 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
VdrP48281 AC142227.1-201ENSMUST00000221371 621 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm2721-202ENSMUST00000222652 459 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
VdrP48281 Vmn1r36-202ENSMUST00000226635 918 ntAPPRIS P2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
VdrP48281 CT009556.2-201ENSMUST00000227980 1123 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
VdrP48281 CT025525.3-201ENSMUST00000228858 366 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
VdrP48281 Cox20-201ENSMUST00000027781 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
VdrP48281 Olfr1489-201ENSMUST00000053113 1111 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
VdrP48281 Olfr1451-201ENSMUST00000063144 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
VdrP48281 Pcdh17-201ENSMUST00000071370 11451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
VdrP48281 Mup2-201ENSMUST00000074700 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
VdrP48281 Vmn1r37-201ENSMUST00000077482 909 ntAPPRIS P2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
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