Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 AC129308.1-201ENSMUST00000223800 2309 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
RxraP28700 P2ry14-201ENSMUST00000065220 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm4952-201ENSMUST00000092931 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm44185-201ENSMUST00000204539 3307 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm38120-201ENSMUST00000195506 4642 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm35206-201ENSMUST00000217945 1642 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm11758-202ENSMUST00000107327 1325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gbp11-202ENSMUST00000171587 1329 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm15448-203ENSMUST00000108620 1828 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
RxraP28700 Lrrc6-201ENSMUST00000023006 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
RxraP28700 Amot-202ENSMUST00000112836 6957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm42711-201ENSMUST00000197060 2302 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm10401-201ENSMUST00000100848 607 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
RxraP28700 Atp5h-203ENSMUST00000106537 682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
RxraP28700 Lrrc51-208ENSMUST00000106968 766 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm11865-201ENSMUST00000118093 859 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
RxraP28700 Rps12-ps5-201ENSMUST00000118272 389 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm13006-201ENSMUST00000118683 214 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm15484-201ENSMUST00000118871 828 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm12944-201ENSMUST00000119262 463 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
RxraP28700 Sh3d2c-ps1-201ENSMUST00000121498 904 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm16093-201ENSMUST00000141455 392 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm7546-201ENSMUST00000146119 966 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm16026-205ENSMUST00000162923 641 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm27401-201ENSMUST00000184052 173 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
RxraP28700 Mir6357-201ENSMUST00000184246 104 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm27159-201ENSMUST00000185132 432 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
RxraP28700 Pdc-204ENSMUST00000191228 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm6197-201ENSMUST00000192273 454 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm8101-201ENSMUST00000192796 478 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
RxraP28700 A930005N03Rik-201ENSMUST00000194920 1247 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
RxraP28700 Kitl-201ENSMUST00000020129 1260 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
RxraP28700 Olfr1251-203ENSMUST00000214750 1040 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
RxraP28700 Tgm4-206ENSMUST00000215247 951 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
RxraP28700 4930466K18Rik-201ENSMUST00000219458 906 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
RxraP28700 AC105167.1-201ENSMUST00000219966 253 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
RxraP28700 AC152819.1-201ENSMUST00000220435 871 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
RxraP28700 CT030182.4-201ENSMUST00000223647 645 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
RxraP28700 Npvf-201ENSMUST00000031853 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
RxraP28700 Adgrg4-201ENSMUST00000096431 1137 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
RxraP28700 Olfr1307-202ENSMUST00000099606 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
RxraP28700 Olfr1306-201ENSMUST00000099607 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
RxraP28700 Tmem100-201ENSMUST00000092788 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
RxraP28700 Ncoa2-202ENSMUST00000068304 8006 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
RxraP28700 Mapre2-202ENSMUST00000115830 2496 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
RxraP28700 D5Ertd577e-202ENSMUST00000202481 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm11217-201ENSMUST00000141162 1729 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
RxraP28700 Map2-202ENSMUST00000077355 5125 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
RxraP28700 Ogdh-203ENSMUST00000093350 4075 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
RxraP28700 Anxa1-201ENSMUST00000025561 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
RxraP28700 Psg17-201ENSMUST00000004655 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
RxraP28700 Tnip3-201ENSMUST00000114236 3769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm36981-201ENSMUST00000192340 4485 ntBASIC7.09□□□□□ -1.28
RxraP28700 Dnajc18-201ENSMUST00000025208 5169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
RxraP28700 Vmn2r15-201ENSMUST00000167133 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
RxraP28700 Bnip3l-201ENSMUST00000022634 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
RxraP28700 Scml2-205ENSMUST00000101113 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm37730-201ENSMUST00000192432 2211 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
RxraP28700 Hcrtr2-201ENSMUST00000063140 3761 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
RxraP28700 Arhgef12-201ENSMUST00000072767 10059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
RxraP28700 4930516K23Rik-201ENSMUST00000074064 6133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
RxraP28700 Olfr615-203ENSMUST00000215673 3469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
RxraP28700 Pramel4-202ENSMUST00000091676 2399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
RxraP28700 Trim30c-201ENSMUST00000106828 1716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
RxraP28700 Plcb1-201ENSMUST00000070724 3853 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
RxraP28700 Fhl4-201ENSMUST00000059383 3402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
RxraP28700 Adh7-201ENSMUST00000090171 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
RxraP28700 Dnajc15-202ENSMUST00000226459 6193 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm15054-201ENSMUST00000117393 281 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm8644-201ENSMUST00000118619 596 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm6877-201ENSMUST00000119347 1101 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm15188-201ENSMUST00000121264 704 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm11681-201ENSMUST00000127337 870 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm9697-201ENSMUST00000147052 997 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm10552-202ENSMUST00000161763 717 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm7502-201ENSMUST00000169235 733 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm19840-201ENSMUST00000169624 882 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm20528-202ENSMUST00000174821 802 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
RxraP28700 Mir199b-201ENSMUST00000175066 110 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm27972-201ENSMUST00000184720 137 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm28894-201ENSMUST00000185214 615 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
RxraP28700 AV026068-205ENSMUST00000186386 762 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm3121-201ENSMUST00000187086 406 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm5575-201ENSMUST00000190879 398 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm28070-201ENSMUST00000191502 445 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm37369-201ENSMUST00000194179 615 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
RxraP28700 Olfr1284-202ENSMUST00000209096 1064 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
RxraP28700 Lncbate1-201ENSMUST00000211953 812 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm45888-201ENSMUST00000212348 1229 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
RxraP28700 Olfr221-203ENSMUST00000214342 1062 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
RxraP28700 AC134468.2-202ENSMUST00000222820 1120 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm18960-201ENSMUST00000222962 713 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
RxraP28700 Mif-ps7-201ENSMUST00000223357 327 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
RxraP28700 AV026068-219ENSMUST00000224148 933 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
RxraP28700 AC117949.1-201ENSMUST00000225547 419 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
RxraP28700 CT009711.4-201ENSMUST00000225685 198 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
RxraP28700 Diaph3-204ENSMUST00000226254 682 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
RxraP28700 Odf3l1-201ENSMUST00000055036 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
RxraP28700 Cbx3-202ENSMUST00000094623 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms