Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Krt27Q9Z320 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Krt27Q9Z320 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Krt27Q9Z320 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Krt27Q9Z320 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt27Q9Z320 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt27Q9Z320 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt27Q9Z320 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt27Q9Z320 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt27Q9Z320 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt27Q9Z320 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt27Q9Z320 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt27Q9Z320 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt27Q9Z320 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt27Q9Z320 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt27Q9Z320 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt27Q9Z320 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt27Q9Z320 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt27Q9Z320 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt27Q9Z320 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt27Q9Z320 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt27Q9Z320 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt27Q9Z320 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt27Q9Z320 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt27Q9Z320 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt27Q9Z320 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt27Q9Z320 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt27Q9Z320 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt27Q9Z320 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt27Q9Z320 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt27Q9Z320 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt27Q9Z320 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt27Q9Z320 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt27Q9Z320 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt27Q9Z320 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt27Q9Z320 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt27Q9Z320 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt27Q9Z320 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt27Q9Z320 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt27Q9Z320 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt27Q9Z320 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt27Q9Z320 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt27Q9Z320 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt27Q9Z320 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt27Q9Z320 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt27Q9Z320 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt27Q9Z320 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt27Q9Z320 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt27Q9Z320 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt27Q9Z320 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt27Q9Z320 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt27Q9Z320 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt27Q9Z320 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt27Q9Z320 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Krt27Q9Z320 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Krt27Q9Z320 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Krt27Q9Z320 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Krt27Q9Z320 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Krt27Q9Z320 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Krt27Q9Z320 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Krt27Q9Z320 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Krt27Q9Z320 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Krt27Q9Z320 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Krt27Q9Z320 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Krt27Q9Z320 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Krt27Q9Z320 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Krt27Q9Z320 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Krt27Q9Z320 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Krt27Q9Z320 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Krt27Q9Z320 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Krt27Q9Z320 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Krt27Q9Z320 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Krt27Q9Z320 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Krt27Q9Z320 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Krt27Q9Z320 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Krt27Q9Z320 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Krt27Q9Z320 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Krt27Q9Z320 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Krt27Q9Z320 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Krt27Q9Z320 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Krt27Q9Z320 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Krt27Q9Z320 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Krt27Q9Z320 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Krt27Q9Z320 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Krt27Q9Z320 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Krt27Q9Z320 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Krt27Q9Z320 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Krt27Q9Z320 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Krt27Q9Z320 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Krt27Q9Z320 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Krt27Q9Z320 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Krt27Q9Z320 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Krt27Q9Z320 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Krt27Q9Z320 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Krt27Q9Z320 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Krt27Q9Z320 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Krt27Q9Z320 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Krt27Q9Z320 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Krt27Q9Z320 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Krt27Q9Z320 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms