Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z309

Cib2, Calcium and integrin-binding family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib2Q9Z309 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cib2Q9Z309 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cib2Q9Z309 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cib2Q9Z309 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cib2Q9Z309 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cib2Q9Z309 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cib2Q9Z309 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cib2Q9Z309 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cib2Q9Z309 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cib2Q9Z309 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cib2Q9Z309 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cib2Q9Z309 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cib2Q9Z309 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cib2Q9Z309 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cib2Q9Z309 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cib2Q9Z309 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cib2Q9Z309 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cib2Q9Z309 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cib2Q9Z309 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cib2Q9Z309 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cib2Q9Z309 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cib2Q9Z309 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cib2Q9Z309 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cib2Q9Z309 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cib2Q9Z309 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cib2Q9Z309 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cib2Q9Z309 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cib2Q9Z309 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cib2Q9Z309 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cib2Q9Z309 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cib2Q9Z309 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cib2Q9Z309 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cib2Q9Z309 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cib2Q9Z309 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cib2Q9Z309 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cib2Q9Z309 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cib2Q9Z309 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cib2Q9Z309 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cib2Q9Z309 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cib2Q9Z309 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cib2Q9Z309 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cib2Q9Z309 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cib2Q9Z309 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cib2Q9Z309 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cib2Q9Z309 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cib2Q9Z309 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cib2Q9Z309 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cib2Q9Z309 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cib2Q9Z309 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cib2Q9Z309 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cib2Q9Z309 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms