Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cldn8Q9Z260 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cldn8Q9Z260 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cldn8Q9Z260 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cldn8Q9Z260 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cldn8Q9Z260 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cldn8Q9Z260 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cldn8Q9Z260 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn8Q9Z260 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn8Q9Z260 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn8Q9Z260 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn8Q9Z260 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn8Q9Z260 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn8Q9Z260 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn8Q9Z260 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn8Q9Z260 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn8Q9Z260 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn8Q9Z260 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cldn8Q9Z260 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cldn8Q9Z260 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn8Q9Z260 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms