Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trip6Q9Z1Y4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trip6Q9Z1Y4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trip6Q9Z1Y4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trip6Q9Z1Y4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trip6Q9Z1Y4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Trip6Q9Z1Y4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trip6Q9Z1Y4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trip6Q9Z1Y4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trip6Q9Z1Y4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trip6Q9Z1Y4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trip6Q9Z1Y4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trip6Q9Z1Y4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trip6Q9Z1Y4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trip6Q9Z1Y4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trip6Q9Z1Y4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Trip6Q9Z1Y4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trip6Q9Z1Y4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trip6Q9Z1Y4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trip6Q9Z1Y4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trip6Q9Z1Y4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trip6Q9Z1Y4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trip6Q9Z1Y4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trip6Q9Z1Y4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trip6Q9Z1Y4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trip6Q9Z1Y4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trip6Q9Z1Y4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trip6Q9Z1Y4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trip6Q9Z1Y4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trip6Q9Z1Y4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trip6Q9Z1Y4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Trip6Q9Z1Y4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trip6Q9Z1Y4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trip6Q9Z1Y4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Trip6Q9Z1Y4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Trip6Q9Z1Y4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trip6Q9Z1Y4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trip6Q9Z1Y4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trip6Q9Z1Y4 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trip6Q9Z1Y4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trip6Q9Z1Y4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trip6Q9Z1Y4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trip6Q9Z1Y4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Trip6Q9Z1Y4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trip6Q9Z1Y4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Trip6Q9Z1Y4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trip6Q9Z1Y4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trip6Q9Z1Y4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trip6Q9Z1Y4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trip6Q9Z1Y4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trip6Q9Z1Y4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trip6Q9Z1Y4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trip6Q9Z1Y4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trip6Q9Z1Y4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trip6Q9Z1Y4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trip6Q9Z1Y4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trip6Q9Z1Y4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trip6Q9Z1Y4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trip6Q9Z1Y4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trip6Q9Z1Y4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trip6Q9Z1Y4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trip6Q9Z1Y4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trip6Q9Z1Y4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trip6Q9Z1Y4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trip6Q9Z1Y4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trip6Q9Z1Y4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trip6Q9Z1Y4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trip6Q9Z1Y4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trip6Q9Z1Y4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trip6Q9Z1Y4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trip6Q9Z1Y4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trip6Q9Z1Y4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trip6Q9Z1Y4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trip6Q9Z1Y4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trip6Q9Z1Y4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trip6Q9Z1Y4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trip6Q9Z1Y4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trip6Q9Z1Y4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trip6Q9Z1Y4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trip6Q9Z1Y4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trip6Q9Z1Y4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trip6Q9Z1Y4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trip6Q9Z1Y4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trip6Q9Z1Y4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trip6Q9Z1Y4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Trip6Q9Z1Y4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trip6Q9Z1Y4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trip6Q9Z1Y4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trip6Q9Z1Y4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trip6Q9Z1Y4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trip6Q9Z1Y4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trip6Q9Z1Y4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trip6Q9Z1Y4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trip6Q9Z1Y4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trip6Q9Z1Y4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Trip6Q9Z1Y4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trip6Q9Z1Y4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trip6Q9Z1Y4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trip6Q9Z1Y4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trip6Q9Z1Y4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms