Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z104

Hmg20b, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20bQ9Z104 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hmg20bQ9Z104 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hmg20bQ9Z104 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hmg20bQ9Z104 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Hmg20bQ9Z104 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hmg20bQ9Z104 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hmg20bQ9Z104 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hmg20bQ9Z104 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hmg20bQ9Z104 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hmg20bQ9Z104 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hmg20bQ9Z104 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hmg20bQ9Z104 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hmg20bQ9Z104 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hmg20bQ9Z104 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hmg20bQ9Z104 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hmg20bQ9Z104 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hmg20bQ9Z104 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hmg20bQ9Z104 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hmg20bQ9Z104 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hmg20bQ9Z104 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hmg20bQ9Z104 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hmg20bQ9Z104 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hmg20bQ9Z104 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hmg20bQ9Z104 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hmg20bQ9Z104 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hmg20bQ9Z104 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hmg20bQ9Z104 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hmg20bQ9Z104 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hmg20bQ9Z104 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hmg20bQ9Z104 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hmg20bQ9Z104 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hmg20bQ9Z104 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hmg20bQ9Z104 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Hmg20bQ9Z104 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hmg20bQ9Z104 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hmg20bQ9Z104 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hmg20bQ9Z104 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hmg20bQ9Z104 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hmg20bQ9Z104 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Hmg20bQ9Z104 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hmg20bQ9Z104 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hmg20bQ9Z104 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hmg20bQ9Z104 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hmg20bQ9Z104 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hmg20bQ9Z104 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hmg20bQ9Z104 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Hmg20bQ9Z104 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hmg20bQ9Z104 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hmg20bQ9Z104 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hmg20bQ9Z104 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hmg20bQ9Z104 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hmg20bQ9Z104 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hmg20bQ9Z104 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hmg20bQ9Z104 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Hmg20bQ9Z104 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hmg20bQ9Z104 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hmg20bQ9Z104 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hmg20bQ9Z104 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Hmg20bQ9Z104 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hmg20bQ9Z104 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Hmg20bQ9Z104 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hmg20bQ9Z104 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Hmg20bQ9Z104 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hmg20bQ9Z104 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hmg20bQ9Z104 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hmg20bQ9Z104 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hmg20bQ9Z104 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hmg20bQ9Z104 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hmg20bQ9Z104 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hmg20bQ9Z104 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hmg20bQ9Z104 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hmg20bQ9Z104 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hmg20bQ9Z104 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hmg20bQ9Z104 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hmg20bQ9Z104 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hmg20bQ9Z104 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Hmg20bQ9Z104 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hmg20bQ9Z104 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hmg20bQ9Z104 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hmg20bQ9Z104 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hmg20bQ9Z104 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hmg20bQ9Z104 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hmg20bQ9Z104 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hmg20bQ9Z104 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hmg20bQ9Z104 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hmg20bQ9Z104 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hmg20bQ9Z104 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hmg20bQ9Z104 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hmg20bQ9Z104 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hmg20bQ9Z104 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hmg20bQ9Z104 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hmg20bQ9Z104 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hmg20bQ9Z104 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hmg20bQ9Z104 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hmg20bQ9Z104 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hmg20bQ9Z104 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hmg20bQ9Z104 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hmg20bQ9Z104 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hmg20bQ9Z104 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hmg20bQ9Z104 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms