Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms