Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W3

Nup160, Nuclear pore complex protein Nup160, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup160Q9Z0W3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Nup160Q9Z0W3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Nup160Q9Z0W3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Nup160Q9Z0W3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Nup160Q9Z0W3 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Nup160Q9Z0W3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Nup160Q9Z0W3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Nup160Q9Z0W3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Nup160Q9Z0W3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Nup160Q9Z0W3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Nup160Q9Z0W3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Nup160Q9Z0W3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Nup160Q9Z0W3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Nup160Q9Z0W3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Nup160Q9Z0W3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Nup160Q9Z0W3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Nup160Q9Z0W3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Nup160Q9Z0W3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Nup160Q9Z0W3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Nup160Q9Z0W3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Nup160Q9Z0W3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Nup160Q9Z0W3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nup160Q9Z0W3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nup160Q9Z0W3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nup160Q9Z0W3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nup160Q9Z0W3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nup160Q9Z0W3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nup160Q9Z0W3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nup160Q9Z0W3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nup160Q9Z0W3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nup160Q9Z0W3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nup160Q9Z0W3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nup160Q9Z0W3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nup160Q9Z0W3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nup160Q9Z0W3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nup160Q9Z0W3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nup160Q9Z0W3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nup160Q9Z0W3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nup160Q9Z0W3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nup160Q9Z0W3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Nup160Q9Z0W3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Nup160Q9Z0W3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Nup160Q9Z0W3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nup160Q9Z0W3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nup160Q9Z0W3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nup160Q9Z0W3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nup160Q9Z0W3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nup160Q9Z0W3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nup160Q9Z0W3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nup160Q9Z0W3 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nup160Q9Z0W3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Nup160Q9Z0W3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nup160Q9Z0W3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nup160Q9Z0W3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nup160Q9Z0W3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nup160Q9Z0W3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nup160Q9Z0W3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nup160Q9Z0W3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nup160Q9Z0W3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nup160Q9Z0W3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nup160Q9Z0W3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nup160Q9Z0W3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Nup160Q9Z0W3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nup160Q9Z0W3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nup160Q9Z0W3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nup160Q9Z0W3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nup160Q9Z0W3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nup160Q9Z0W3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nup160Q9Z0W3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nup160Q9Z0W3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nup160Q9Z0W3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Nup160Q9Z0W3 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nup160Q9Z0W3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nup160Q9Z0W3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nup160Q9Z0W3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nup160Q9Z0W3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Nup160Q9Z0W3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Nup160Q9Z0W3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Nup160Q9Z0W3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Nup160Q9Z0W3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Nup160Q9Z0W3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Nup160Q9Z0W3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nup160Q9Z0W3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nup160Q9Z0W3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nup160Q9Z0W3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nup160Q9Z0W3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nup160Q9Z0W3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nup160Q9Z0W3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nup160Q9Z0W3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nup160Q9Z0W3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nup160Q9Z0W3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Nup160Q9Z0W3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nup160Q9Z0W3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nup160Q9Z0W3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Nup160Q9Z0W3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Nup160Q9Z0W3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nup160Q9Z0W3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nup160Q9Z0W3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nup160Q9Z0W3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nup160Q9Z0W3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms