Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clip2Q9Z0H8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Clip2Q9Z0H8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clip2Q9Z0H8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clip2Q9Z0H8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clip2Q9Z0H8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clip2Q9Z0H8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clip2Q9Z0H8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clip2Q9Z0H8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Clip2Q9Z0H8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Clip2Q9Z0H8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Clip2Q9Z0H8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clip2Q9Z0H8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clip2Q9Z0H8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clip2Q9Z0H8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clip2Q9Z0H8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clip2Q9Z0H8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Clip2Q9Z0H8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clip2Q9Z0H8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clip2Q9Z0H8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Clip2Q9Z0H8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Clip2Q9Z0H8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clip2Q9Z0H8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clip2Q9Z0H8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clip2Q9Z0H8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clip2Q9Z0H8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clip2Q9Z0H8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Clip2Q9Z0H8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Clip2Q9Z0H8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Clip2Q9Z0H8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Clip2Q9Z0H8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
Clip2Q9Z0H8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clip2Q9Z0H8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clip2Q9Z0H8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Clip2Q9Z0H8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Clip2Q9Z0H8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clip2Q9Z0H8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Clip2Q9Z0H8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clip2Q9Z0H8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Clip2Q9Z0H8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clip2Q9Z0H8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Clip2Q9Z0H8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clip2Q9Z0H8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clip2Q9Z0H8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clip2Q9Z0H8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Clip2Q9Z0H8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clip2Q9Z0H8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clip2Q9Z0H8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clip2Q9Z0H8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Clip2Q9Z0H8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Clip2Q9Z0H8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Clip2Q9Z0H8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clip2Q9Z0H8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clip2Q9Z0H8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clip2Q9Z0H8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clip2Q9Z0H8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clip2Q9Z0H8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clip2Q9Z0H8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clip2Q9Z0H8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clip2Q9Z0H8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clip2Q9Z0H8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clip2Q9Z0H8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clip2Q9Z0H8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clip2Q9Z0H8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clip2Q9Z0H8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clip2Q9Z0H8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clip2Q9Z0H8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clip2Q9Z0H8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clip2Q9Z0H8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clip2Q9Z0H8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clip2Q9Z0H8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clip2Q9Z0H8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clip2Q9Z0H8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clip2Q9Z0H8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clip2Q9Z0H8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clip2Q9Z0H8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clip2Q9Z0H8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clip2Q9Z0H8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clip2Q9Z0H8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clip2Q9Z0H8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clip2Q9Z0H8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clip2Q9Z0H8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clip2Q9Z0H8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clip2Q9Z0H8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clip2Q9Z0H8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Clip2Q9Z0H8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Clip2Q9Z0H8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clip2Q9Z0H8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clip2Q9Z0H8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Clip2Q9Z0H8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clip2Q9Z0H8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clip2Q9Z0H8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clip2Q9Z0H8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clip2Q9Z0H8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clip2Q9Z0H8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clip2Q9Z0H8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Clip2Q9Z0H8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clip2Q9Z0H8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clip2Q9Z0H8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clip2Q9Z0H8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms