Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV35

Apobec2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec2Q9WV35 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Apobec2Q9WV35 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Apobec2Q9WV35 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Apobec2Q9WV35 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Apobec2Q9WV35 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Apobec2Q9WV35 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Apobec2Q9WV35 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Apobec2Q9WV35 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Apobec2Q9WV35 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Apobec2Q9WV35 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Apobec2Q9WV35 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Apobec2Q9WV35 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Apobec2Q9WV35 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apobec2Q9WV35 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apobec2Q9WV35 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Apobec2Q9WV35 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apobec2Q9WV35 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apobec2Q9WV35 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apobec2Q9WV35 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apobec2Q9WV35 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apobec2Q9WV35 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apobec2Q9WV35 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apobec2Q9WV35 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apobec2Q9WV35 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apobec2Q9WV35 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apobec2Q9WV35 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apobec2Q9WV35 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apobec2Q9WV35 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apobec2Q9WV35 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apobec2Q9WV35 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apobec2Q9WV35 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apobec2Q9WV35 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apobec2Q9WV35 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apobec2Q9WV35 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apobec2Q9WV35 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apobec2Q9WV35 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms