Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nrf1Q9WU00 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nrf1Q9WU00 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nrf1Q9WU00 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nrf1Q9WU00 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Nrf1Q9WU00 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nrf1Q9WU00 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nrf1Q9WU00 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nrf1Q9WU00 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nrf1Q9WU00 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nrf1Q9WU00 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nrf1Q9WU00 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nrf1Q9WU00 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nrf1Q9WU00 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nrf1Q9WU00 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nrf1Q9WU00 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nrf1Q9WU00 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nrf1Q9WU00 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms