Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms