Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM4

Nfe2l3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2l3Q9WTM4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nfe2l3Q9WTM4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nfe2l3Q9WTM4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nfe2l3Q9WTM4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nfe2l3Q9WTM4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nfe2l3Q9WTM4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nfe2l3Q9WTM4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nfe2l3Q9WTM4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nfe2l3Q9WTM4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nfe2l3Q9WTM4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nfe2l3Q9WTM4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nfe2l3Q9WTM4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nfe2l3Q9WTM4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nfe2l3Q9WTM4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nfe2l3Q9WTM4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nfe2l3Q9WTM4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nfe2l3Q9WTM4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nfe2l3Q9WTM4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nfe2l3Q9WTM4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nfe2l3Q9WTM4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nfe2l3Q9WTM4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nfe2l3Q9WTM4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nfe2l3Q9WTM4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nfe2l3Q9WTM4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nfe2l3Q9WTM4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nfe2l3Q9WTM4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nfe2l3Q9WTM4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nfe2l3Q9WTM4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nfe2l3Q9WTM4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nfe2l3Q9WTM4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nfe2l3Q9WTM4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nfe2l3Q9WTM4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nfe2l3Q9WTM4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nfe2l3Q9WTM4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nfe2l3Q9WTM4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Nfe2l3Q9WTM4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nfe2l3Q9WTM4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nfe2l3Q9WTM4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Nfe2l3Q9WTM4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nfe2l3Q9WTM4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nfe2l3Q9WTM4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nfe2l3Q9WTM4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nfe2l3Q9WTM4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nfe2l3Q9WTM4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nfe2l3Q9WTM4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nfe2l3Q9WTM4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nfe2l3Q9WTM4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nfe2l3Q9WTM4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nfe2l3Q9WTM4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nfe2l3Q9WTM4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Nfe2l3Q9WTM4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nfe2l3Q9WTM4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nfe2l3Q9WTM4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nfe2l3Q9WTM4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nfe2l3Q9WTM4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nfe2l3Q9WTM4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nfe2l3Q9WTM4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nfe2l3Q9WTM4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nfe2l3Q9WTM4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nfe2l3Q9WTM4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nfe2l3Q9WTM4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nfe2l3Q9WTM4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nfe2l3Q9WTM4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nfe2l3Q9WTM4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nfe2l3Q9WTM4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nfe2l3Q9WTM4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nfe2l3Q9WTM4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nfe2l3Q9WTM4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nfe2l3Q9WTM4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nfe2l3Q9WTM4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Nfe2l3Q9WTM4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nfe2l3Q9WTM4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nfe2l3Q9WTM4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nfe2l3Q9WTM4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nfe2l3Q9WTM4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nfe2l3Q9WTM4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nfe2l3Q9WTM4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Nfe2l3Q9WTM4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nfe2l3Q9WTM4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nfe2l3Q9WTM4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nfe2l3Q9WTM4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nfe2l3Q9WTM4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nfe2l3Q9WTM4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nfe2l3Q9WTM4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nfe2l3Q9WTM4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nfe2l3Q9WTM4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Nfe2l3Q9WTM4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nfe2l3Q9WTM4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nfe2l3Q9WTM4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nfe2l3Q9WTM4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nfe2l3Q9WTM4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nfe2l3Q9WTM4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nfe2l3Q9WTM4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nfe2l3Q9WTM4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nfe2l3Q9WTM4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nfe2l3Q9WTM4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nfe2l3Q9WTM4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nfe2l3Q9WTM4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nfe2l3Q9WTM4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nfe2l3Q9WTM4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms