Protein–RNA interactions for Protein: Q9R269

Ppl, Periplakin, mousemouse

Predictions only

Length 1,755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PplQ9R269 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PplQ9R269 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PplQ9R269 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PplQ9R269 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PplQ9R269 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PplQ9R269 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PplQ9R269 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PplQ9R269 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PplQ9R269 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PplQ9R269 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PplQ9R269 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PplQ9R269 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PplQ9R269 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PplQ9R269 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PplQ9R269 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PplQ9R269 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PplQ9R269 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PplQ9R269 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PplQ9R269 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PplQ9R269 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PplQ9R269 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PplQ9R269 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PplQ9R269 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PplQ9R269 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PplQ9R269 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PplQ9R269 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PplQ9R269 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PplQ9R269 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PplQ9R269 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PplQ9R269 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PplQ9R269 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PplQ9R269 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PplQ9R269 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PplQ9R269 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PplQ9R269 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PplQ9R269 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PplQ9R269 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PplQ9R269 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PplQ9R269 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PplQ9R269 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PplQ9R269 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PplQ9R269 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PplQ9R269 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PplQ9R269 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PplQ9R269 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PplQ9R269 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PplQ9R269 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PplQ9R269 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PplQ9R269 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PplQ9R269 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PplQ9R269 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PplQ9R269 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PplQ9R269 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PplQ9R269 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PplQ9R269 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PplQ9R269 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PplQ9R269 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PplQ9R269 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PplQ9R269 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PplQ9R269 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PplQ9R269 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PplQ9R269 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PplQ9R269 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PplQ9R269 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PplQ9R269 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PplQ9R269 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PplQ9R269 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PplQ9R269 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PplQ9R269 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PplQ9R269 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PplQ9R269 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PplQ9R269 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PplQ9R269 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PplQ9R269 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PplQ9R269 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PplQ9R269 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PplQ9R269 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PplQ9R269 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PplQ9R269 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PplQ9R269 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PplQ9R269 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PplQ9R269 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PplQ9R269 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PplQ9R269 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PplQ9R269 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PplQ9R269 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PplQ9R269 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PplQ9R269 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PplQ9R269 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PplQ9R269 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PplQ9R269 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PplQ9R269 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PplQ9R269 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PplQ9R269 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PplQ9R269 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PplQ9R269 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PplQ9R269 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PplQ9R269 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PplQ9R269 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PplQ9R269 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms