Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G7

Zeb2, Zinc finger E-box-binding homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb2Q9R0G7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zeb2Q9R0G7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zeb2Q9R0G7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zeb2Q9R0G7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zeb2Q9R0G7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zeb2Q9R0G7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zeb2Q9R0G7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zeb2Q9R0G7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zeb2Q9R0G7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zeb2Q9R0G7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zeb2Q9R0G7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zeb2Q9R0G7 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zeb2Q9R0G7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zeb2Q9R0G7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zeb2Q9R0G7 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zeb2Q9R0G7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zeb2Q9R0G7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Zeb2Q9R0G7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Zeb2Q9R0G7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Zeb2Q9R0G7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Zeb2Q9R0G7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Zeb2Q9R0G7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Zeb2Q9R0G7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Zeb2Q9R0G7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zeb2Q9R0G7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zeb2Q9R0G7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zeb2Q9R0G7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zeb2Q9R0G7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zeb2Q9R0G7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zeb2Q9R0G7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zeb2Q9R0G7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zeb2Q9R0G7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zeb2Q9R0G7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zeb2Q9R0G7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Zeb2Q9R0G7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zeb2Q9R0G7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zeb2Q9R0G7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zeb2Q9R0G7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Zeb2Q9R0G7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Zeb2Q9R0G7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Zeb2Q9R0G7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Zeb2Q9R0G7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Zeb2Q9R0G7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zeb2Q9R0G7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zeb2Q9R0G7 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zeb2Q9R0G7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zeb2Q9R0G7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zeb2Q9R0G7 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zeb2Q9R0G7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zeb2Q9R0G7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zeb2Q9R0G7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zeb2Q9R0G7 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Zeb2Q9R0G7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Zeb2Q9R0G7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Zeb2Q9R0G7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Zeb2Q9R0G7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Zeb2Q9R0G7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Zeb2Q9R0G7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zeb2Q9R0G7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zeb2Q9R0G7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zeb2Q9R0G7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zeb2Q9R0G7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zeb2Q9R0G7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zeb2Q9R0G7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zeb2Q9R0G7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zeb2Q9R0G7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zeb2Q9R0G7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Zeb2Q9R0G7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zeb2Q9R0G7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zeb2Q9R0G7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zeb2Q9R0G7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zeb2Q9R0G7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zeb2Q9R0G7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zeb2Q9R0G7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zeb2Q9R0G7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zeb2Q9R0G7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zeb2Q9R0G7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zeb2Q9R0G7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zeb2Q9R0G7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zeb2Q9R0G7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zeb2Q9R0G7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Zeb2Q9R0G7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zeb2Q9R0G7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zeb2Q9R0G7 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Zeb2Q9R0G7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zeb2Q9R0G7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Zeb2Q9R0G7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zeb2Q9R0G7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zeb2Q9R0G7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zeb2Q9R0G7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zeb2Q9R0G7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zeb2Q9R0G7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zeb2Q9R0G7 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Zeb2Q9R0G7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zeb2Q9R0G7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Zeb2Q9R0G7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zeb2Q9R0G7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zeb2Q9R0G7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zeb2Q9R0G7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zeb2Q9R0G7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms