Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0C8

Vav3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav3Q9R0C8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vav3Q9R0C8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Vav3Q9R0C8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vav3Q9R0C8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vav3Q9R0C8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vav3Q9R0C8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vav3Q9R0C8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vav3Q9R0C8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vav3Q9R0C8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vav3Q9R0C8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vav3Q9R0C8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vav3Q9R0C8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vav3Q9R0C8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vav3Q9R0C8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vav3Q9R0C8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vav3Q9R0C8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vav3Q9R0C8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vav3Q9R0C8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vav3Q9R0C8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vav3Q9R0C8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vav3Q9R0C8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vav3Q9R0C8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vav3Q9R0C8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vav3Q9R0C8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vav3Q9R0C8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Vav3Q9R0C8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Vav3Q9R0C8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vav3Q9R0C8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vav3Q9R0C8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vav3Q9R0C8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vav3Q9R0C8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vav3Q9R0C8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Vav3Q9R0C8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vav3Q9R0C8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vav3Q9R0C8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vav3Q9R0C8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vav3Q9R0C8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vav3Q9R0C8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vav3Q9R0C8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Vav3Q9R0C8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vav3Q9R0C8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vav3Q9R0C8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Vav3Q9R0C8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vav3Q9R0C8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vav3Q9R0C8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vav3Q9R0C8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vav3Q9R0C8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vav3Q9R0C8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vav3Q9R0C8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vav3Q9R0C8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vav3Q9R0C8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vav3Q9R0C8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Vav3Q9R0C8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vav3Q9R0C8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vav3Q9R0C8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vav3Q9R0C8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vav3Q9R0C8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vav3Q9R0C8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vav3Q9R0C8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vav3Q9R0C8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vav3Q9R0C8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Vav3Q9R0C8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vav3Q9R0C8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vav3Q9R0C8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vav3Q9R0C8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vav3Q9R0C8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vav3Q9R0C8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vav3Q9R0C8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vav3Q9R0C8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vav3Q9R0C8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vav3Q9R0C8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vav3Q9R0C8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Vav3Q9R0C8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vav3Q9R0C8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vav3Q9R0C8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vav3Q9R0C8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Vav3Q9R0C8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vav3Q9R0C8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vav3Q9R0C8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Vav3Q9R0C8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vav3Q9R0C8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vav3Q9R0C8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Vav3Q9R0C8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Vav3Q9R0C8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Vav3Q9R0C8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vav3Q9R0C8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vav3Q9R0C8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vav3Q9R0C8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vav3Q9R0C8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vav3Q9R0C8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vav3Q9R0C8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vav3Q9R0C8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vav3Q9R0C8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vav3Q9R0C8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vav3Q9R0C8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vav3Q9R0C8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vav3Q9R0C8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vav3Q9R0C8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vav3Q9R0C8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vav3Q9R0C8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms