Protein–RNA interactions for Protein: Q9R060

Nubp1, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP1, mousemouse

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Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nubp1Q9R060 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Nubp1Q9R060 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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Nubp1Q9R060 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Nubp1Q9R060 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Nubp1Q9R060 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Nubp1Q9R060 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nubp1Q9R060 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nubp1Q9R060 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nubp1Q9R060 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nubp1Q9R060 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nubp1Q9R060 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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