Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AmfrQ9R049 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AmfrQ9R049 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AmfrQ9R049 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AmfrQ9R049 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AmfrQ9R049 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AmfrQ9R049 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AmfrQ9R049 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AmfrQ9R049 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AmfrQ9R049 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AmfrQ9R049 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AmfrQ9R049 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AmfrQ9R049 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AmfrQ9R049 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AmfrQ9R049 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AmfrQ9R049 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AmfrQ9R049 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AmfrQ9R049 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
AmfrQ9R049 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AmfrQ9R049 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AmfrQ9R049 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AmfrQ9R049 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AmfrQ9R049 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AmfrQ9R049 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AmfrQ9R049 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
AmfrQ9R049 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AmfrQ9R049 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AmfrQ9R049 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
AmfrQ9R049 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AmfrQ9R049 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AmfrQ9R049 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AmfrQ9R049 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AmfrQ9R049 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AmfrQ9R049 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AmfrQ9R049 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AmfrQ9R049 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AmfrQ9R049 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AmfrQ9R049 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AmfrQ9R049 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AmfrQ9R049 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AmfrQ9R049 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
AmfrQ9R049 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AmfrQ9R049 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AmfrQ9R049 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
AmfrQ9R049 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AmfrQ9R049 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AmfrQ9R049 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AmfrQ9R049 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AmfrQ9R049 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AmfrQ9R049 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AmfrQ9R049 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AmfrQ9R049 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
AmfrQ9R049 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AmfrQ9R049 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AmfrQ9R049 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AmfrQ9R049 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
AmfrQ9R049 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AmfrQ9R049 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AmfrQ9R049 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AmfrQ9R049 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AmfrQ9R049 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AmfrQ9R049 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AmfrQ9R049 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AmfrQ9R049 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AmfrQ9R049 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AmfrQ9R049 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AmfrQ9R049 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AmfrQ9R049 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AmfrQ9R049 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AmfrQ9R049 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AmfrQ9R049 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AmfrQ9R049 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AmfrQ9R049 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AmfrQ9R049 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AmfrQ9R049 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AmfrQ9R049 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AmfrQ9R049 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
AmfrQ9R049 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AmfrQ9R049 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
AmfrQ9R049 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
AmfrQ9R049 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AmfrQ9R049 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AmfrQ9R049 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
AmfrQ9R049 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AmfrQ9R049 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AmfrQ9R049 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AmfrQ9R049 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AmfrQ9R049 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AmfrQ9R049 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AmfrQ9R049 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AmfrQ9R049 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AmfrQ9R049 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AmfrQ9R049 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
AmfrQ9R049 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AmfrQ9R049 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AmfrQ9R049 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AmfrQ9R049 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AmfrQ9R049 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AmfrQ9R049 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AmfrQ9R049 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms