Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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