Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Opn4Q9QXZ9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms