Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Trim44Q9QXA7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Trim44Q9QXA7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim44Q9QXA7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trim44Q9QXA7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim44Q9QXA7 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim44Q9QXA7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim44Q9QXA7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim44Q9QXA7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim44Q9QXA7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim44Q9QXA7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim44Q9QXA7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim44Q9QXA7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim44Q9QXA7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim44Q9QXA7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim44Q9QXA7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim44Q9QXA7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim44Q9QXA7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim44Q9QXA7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim44Q9QXA7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim44Q9QXA7 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim44Q9QXA7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim44Q9QXA7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim44Q9QXA7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim44Q9QXA7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim44Q9QXA7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim44Q9QXA7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim44Q9QXA7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim44Q9QXA7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim44Q9QXA7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim44Q9QXA7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim44Q9QXA7 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim44Q9QXA7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim44Q9QXA7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim44Q9QXA7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim44Q9QXA7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim44Q9QXA7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim44Q9QXA7 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim44Q9QXA7 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim44Q9QXA7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim44Q9QXA7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim44Q9QXA7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim44Q9QXA7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim44Q9QXA7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim44Q9QXA7 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim44Q9QXA7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim44Q9QXA7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim44Q9QXA7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim44Q9QXA7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim44Q9QXA7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim44Q9QXA7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim44Q9QXA7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim44Q9QXA7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim44Q9QXA7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim44Q9QXA7 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim44Q9QXA7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim44Q9QXA7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim44Q9QXA7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim44Q9QXA7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim44Q9QXA7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim44Q9QXA7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim44Q9QXA7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim44Q9QXA7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim44Q9QXA7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim44Q9QXA7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim44Q9QXA7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim44Q9QXA7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim44Q9QXA7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim44Q9QXA7 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim44Q9QXA7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim44Q9QXA7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim44Q9QXA7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim44Q9QXA7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim44Q9QXA7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Trim44Q9QXA7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Trim44Q9QXA7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Trim44Q9QXA7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim44Q9QXA7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim44Q9QXA7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim44Q9QXA7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim44Q9QXA7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim44Q9QXA7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim44Q9QXA7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim44Q9QXA7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim44Q9QXA7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim44Q9QXA7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim44Q9QXA7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim44Q9QXA7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim44Q9QXA7 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim44Q9QXA7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim44Q9QXA7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim44Q9QXA7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim44Q9QXA7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim44Q9QXA7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim44Q9QXA7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim44Q9QXA7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim44Q9QXA7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim44Q9QXA7 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim44Q9QXA7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim44Q9QXA7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.4 ms