Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK6

Tlr4, Toll-like receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr4Q9QUK6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tlr4Q9QUK6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tlr4Q9QUK6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tlr4Q9QUK6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Tlr4Q9QUK6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tlr4Q9QUK6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms