Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SrfQ9JM73 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SrfQ9JM73 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SrfQ9JM73 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SrfQ9JM73 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SrfQ9JM73 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SrfQ9JM73 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SrfQ9JM73 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SrfQ9JM73 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SrfQ9JM73 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SrfQ9JM73 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SrfQ9JM73 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SrfQ9JM73 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SrfQ9JM73 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SrfQ9JM73 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SrfQ9JM73 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SrfQ9JM73 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SrfQ9JM73 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SrfQ9JM73 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SrfQ9JM73 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SrfQ9JM73 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SrfQ9JM73 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SrfQ9JM73 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SrfQ9JM73 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SrfQ9JM73 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SrfQ9JM73 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SrfQ9JM73 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SrfQ9JM73 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SrfQ9JM73 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrfQ9JM73 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrfQ9JM73 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SrfQ9JM73 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrfQ9JM73 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrfQ9JM73 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrfQ9JM73 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrfQ9JM73 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrfQ9JM73 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrfQ9JM73 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrfQ9JM73 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrfQ9JM73 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrfQ9JM73 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SrfQ9JM73 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrfQ9JM73 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrfQ9JM73 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrfQ9JM73 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrfQ9JM73 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrfQ9JM73 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrfQ9JM73 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrfQ9JM73 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrfQ9JM73 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrfQ9JM73 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrfQ9JM73 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrfQ9JM73 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrfQ9JM73 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrfQ9JM73 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrfQ9JM73 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrfQ9JM73 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrfQ9JM73 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrfQ9JM73 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrfQ9JM73 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrfQ9JM73 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SrfQ9JM73 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrfQ9JM73 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrfQ9JM73 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrfQ9JM73 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrfQ9JM73 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrfQ9JM73 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrfQ9JM73 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrfQ9JM73 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrfQ9JM73 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrfQ9JM73 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrfQ9JM73 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrfQ9JM73 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrfQ9JM73 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrfQ9JM73 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrfQ9JM73 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrfQ9JM73 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrfQ9JM73 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrfQ9JM73 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrfQ9JM73 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SrfQ9JM73 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SrfQ9JM73 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SrfQ9JM73 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SrfQ9JM73 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SrfQ9JM73 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SrfQ9JM73 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SrfQ9JM73 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SrfQ9JM73 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SrfQ9JM73 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SrfQ9JM73 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SrfQ9JM73 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SrfQ9JM73 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SrfQ9JM73 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SrfQ9JM73 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SrfQ9JM73 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SrfQ9JM73 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SrfQ9JM73 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SrfQ9JM73 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SrfQ9JM73 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SrfQ9JM73 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms