Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV2

Trpc4ap, Short transient receptor potential channel 4-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc4apQ9JLV2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trpc4apQ9JLV2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trpc4apQ9JLV2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trpc4apQ9JLV2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trpc4apQ9JLV2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trpc4apQ9JLV2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trpc4apQ9JLV2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc4apQ9JLV2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc4apQ9JLV2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc4apQ9JLV2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc4apQ9JLV2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc4apQ9JLV2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc4apQ9JLV2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc4apQ9JLV2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc4apQ9JLV2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc4apQ9JLV2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc4apQ9JLV2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc4apQ9JLV2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc4apQ9JLV2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc4apQ9JLV2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc4apQ9JLV2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc4apQ9JLV2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc4apQ9JLV2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc4apQ9JLV2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc4apQ9JLV2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc4apQ9JLV2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc4apQ9JLV2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc4apQ9JLV2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc4apQ9JLV2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc4apQ9JLV2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc4apQ9JLV2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc4apQ9JLV2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc4apQ9JLV2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc4apQ9JLV2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc4apQ9JLV2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc4apQ9JLV2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trpc4apQ9JLV2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc4apQ9JLV2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc4apQ9JLV2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trpc4apQ9JLV2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc4apQ9JLV2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc4apQ9JLV2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc4apQ9JLV2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc4apQ9JLV2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trpc4apQ9JLV2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc4apQ9JLV2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc4apQ9JLV2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc4apQ9JLV2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc4apQ9JLV2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc4apQ9JLV2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc4apQ9JLV2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc4apQ9JLV2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc4apQ9JLV2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc4apQ9JLV2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc4apQ9JLV2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc4apQ9JLV2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc4apQ9JLV2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc4apQ9JLV2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc4apQ9JLV2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc4apQ9JLV2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc4apQ9JLV2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc4apQ9JLV2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc4apQ9JLV2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc4apQ9JLV2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc4apQ9JLV2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc4apQ9JLV2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc4apQ9JLV2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc4apQ9JLV2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc4apQ9JLV2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc4apQ9JLV2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc4apQ9JLV2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc4apQ9JLV2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc4apQ9JLV2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc4apQ9JLV2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc4apQ9JLV2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc4apQ9JLV2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc4apQ9JLV2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc4apQ9JLV2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc4apQ9JLV2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc4apQ9JLV2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc4apQ9JLV2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc4apQ9JLV2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpc4apQ9JLV2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpc4apQ9JLV2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms