Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gde1Q9JL56 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gde1Q9JL56 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gde1Q9JL56 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gde1Q9JL56 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gde1Q9JL56 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gde1Q9JL56 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gde1Q9JL56 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gde1Q9JL56 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gde1Q9JL56 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gde1Q9JL56 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gde1Q9JL56 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gde1Q9JL56 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gde1Q9JL56 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gde1Q9JL56 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gde1Q9JL56 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gde1Q9JL56 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gde1Q9JL56 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gde1Q9JL56 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gde1Q9JL56 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gde1Q9JL56 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gde1Q9JL56 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gde1Q9JL56 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gde1Q9JL56 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gde1Q9JL56 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gde1Q9JL56 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gde1Q9JL56 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gde1Q9JL56 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gde1Q9JL56 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gde1Q9JL56 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gde1Q9JL56 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gde1Q9JL56 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gde1Q9JL56 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gde1Q9JL56 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gde1Q9JL56 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gde1Q9JL56 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gde1Q9JL56 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gde1Q9JL56 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gde1Q9JL56 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gde1Q9JL56 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gde1Q9JL56 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gde1Q9JL56 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gde1Q9JL56 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gde1Q9JL56 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gde1Q9JL56 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gde1Q9JL56 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gde1Q9JL56 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gde1Q9JL56 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gde1Q9JL56 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gde1Q9JL56 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Gde1Q9JL56 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gde1Q9JL56 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gde1Q9JL56 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gde1Q9JL56 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms