Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms