Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY4

Ddx20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx20Q9JJY4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddx20Q9JJY4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddx20Q9JJY4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddx20Q9JJY4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddx20Q9JJY4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddx20Q9JJY4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddx20Q9JJY4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddx20Q9JJY4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddx20Q9JJY4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddx20Q9JJY4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddx20Q9JJY4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddx20Q9JJY4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddx20Q9JJY4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddx20Q9JJY4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddx20Q9JJY4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddx20Q9JJY4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddx20Q9JJY4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddx20Q9JJY4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddx20Q9JJY4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddx20Q9JJY4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddx20Q9JJY4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddx20Q9JJY4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddx20Q9JJY4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddx20Q9JJY4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddx20Q9JJY4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddx20Q9JJY4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddx20Q9JJY4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddx20Q9JJY4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddx20Q9JJY4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddx20Q9JJY4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ddx20Q9JJY4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ddx20Q9JJY4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ddx20Q9JJY4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ddx20Q9JJY4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ddx20Q9JJY4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ddx20Q9JJY4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ddx20Q9JJY4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ddx20Q9JJY4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ddx20Q9JJY4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ddx20Q9JJY4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ddx20Q9JJY4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Ddx20Q9JJY4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ddx20Q9JJY4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ddx20Q9JJY4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ddx20Q9JJY4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ddx20Q9JJY4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ddx20Q9JJY4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ddx20Q9JJY4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ddx20Q9JJY4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ddx20Q9JJY4 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ddx20Q9JJY4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ddx20Q9JJY4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ddx20Q9JJY4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ddx20Q9JJY4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ddx20Q9JJY4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ddx20Q9JJY4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddx20Q9JJY4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddx20Q9JJY4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddx20Q9JJY4 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddx20Q9JJY4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddx20Q9JJY4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddx20Q9JJY4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddx20Q9JJY4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddx20Q9JJY4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddx20Q9JJY4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddx20Q9JJY4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddx20Q9JJY4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ddx20Q9JJY4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ddx20Q9JJY4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ddx20Q9JJY4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ddx20Q9JJY4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ddx20Q9JJY4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ddx20Q9JJY4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ddx20Q9JJY4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ddx20Q9JJY4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ddx20Q9JJY4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ddx20Q9JJY4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ddx20Q9JJY4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ddx20Q9JJY4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ddx20Q9JJY4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ddx20Q9JJY4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ddx20Q9JJY4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ddx20Q9JJY4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ddx20Q9JJY4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ddx20Q9JJY4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ddx20Q9JJY4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ddx20Q9JJY4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ddx20Q9JJY4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ddx20Q9JJY4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ddx20Q9JJY4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ddx20Q9JJY4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ddx20Q9JJY4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ddx20Q9JJY4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ddx20Q9JJY4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ddx20Q9JJY4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ddx20Q9JJY4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ddx20Q9JJY4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ddx20Q9JJY4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ddx20Q9JJY4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ddx20Q9JJY4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
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