Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI74

Klhl1, Kelch-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl1Q9JI74 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Klhl1Q9JI74 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Klhl1Q9JI74 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Klhl1Q9JI74 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Klhl1Q9JI74 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.5 ms