Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHE7

Tssc4, Protein TSSC4, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tssc4Q9JHE7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tssc4Q9JHE7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tssc4Q9JHE7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tssc4Q9JHE7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tssc4Q9JHE7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tssc4Q9JHE7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tssc4Q9JHE7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tssc4Q9JHE7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tssc4Q9JHE7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tssc4Q9JHE7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tssc4Q9JHE7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tssc4Q9JHE7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tssc4Q9JHE7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tssc4Q9JHE7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tssc4Q9JHE7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tssc4Q9JHE7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tssc4Q9JHE7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tssc4Q9JHE7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tssc4Q9JHE7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tssc4Q9JHE7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tssc4Q9JHE7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tssc4Q9JHE7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tssc4Q9JHE7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tssc4Q9JHE7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tssc4Q9JHE7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tssc4Q9JHE7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tssc4Q9JHE7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tssc4Q9JHE7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tssc4Q9JHE7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tssc4Q9JHE7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tssc4Q9JHE7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tssc4Q9JHE7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tssc4Q9JHE7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tssc4Q9JHE7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tssc4Q9JHE7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tssc4Q9JHE7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tssc4Q9JHE7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tssc4Q9JHE7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tssc4Q9JHE7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tssc4Q9JHE7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tssc4Q9JHE7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tssc4Q9JHE7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tssc4Q9JHE7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tssc4Q9JHE7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tssc4Q9JHE7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tssc4Q9JHE7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tssc4Q9JHE7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tssc4Q9JHE7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tssc4Q9JHE7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tssc4Q9JHE7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tssc4Q9JHE7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tssc4Q9JHE7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tssc4Q9JHE7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tssc4Q9JHE7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tssc4Q9JHE7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tssc4Q9JHE7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tssc4Q9JHE7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tssc4Q9JHE7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tssc4Q9JHE7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tssc4Q9JHE7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tssc4Q9JHE7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tssc4Q9JHE7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tssc4Q9JHE7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tssc4Q9JHE7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tssc4Q9JHE7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tssc4Q9JHE7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tssc4Q9JHE7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tssc4Q9JHE7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tssc4Q9JHE7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tssc4Q9JHE7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tssc4Q9JHE7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tssc4Q9JHE7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tssc4Q9JHE7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tssc4Q9JHE7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tssc4Q9JHE7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tssc4Q9JHE7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tssc4Q9JHE7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tssc4Q9JHE7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tssc4Q9JHE7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tssc4Q9JHE7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tssc4Q9JHE7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tssc4Q9JHE7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tssc4Q9JHE7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tssc4Q9JHE7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tssc4Q9JHE7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tssc4Q9JHE7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tssc4Q9JHE7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tssc4Q9JHE7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tssc4Q9JHE7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tssc4Q9JHE7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tssc4Q9JHE7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tssc4Q9JHE7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tssc4Q9JHE7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tssc4Q9JHE7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tssc4Q9JHE7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tssc4Q9JHE7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tssc4Q9JHE7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tssc4Q9JHE7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tssc4Q9JHE7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tssc4Q9JHE7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms