Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET80

Jph1, Junctophilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jph1Q9ET80 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Jph1Q9ET80 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Jph1Q9ET80 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Jph1Q9ET80 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Jph1Q9ET80 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Jph1Q9ET80 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Jph1Q9ET80 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Jph1Q9ET80 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Jph1Q9ET80 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Jph1Q9ET80 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Jph1Q9ET80 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Jph1Q9ET80 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Jph1Q9ET80 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Jph1Q9ET80 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Jph1Q9ET80 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Jph1Q9ET80 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Jph1Q9ET80 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Jph1Q9ET80 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Jph1Q9ET80 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Jph1Q9ET80 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Jph1Q9ET80 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Jph1Q9ET80 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Jph1Q9ET80 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Jph1Q9ET80 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Jph1Q9ET80 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Jph1Q9ET80 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Jph1Q9ET80 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Jph1Q9ET80 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Jph1Q9ET80 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Jph1Q9ET80 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Jph1Q9ET80 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Jph1Q9ET80 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Jph1Q9ET80 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Jph1Q9ET80 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Jph1Q9ET80 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Jph1Q9ET80 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Jph1Q9ET80 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Jph1Q9ET80 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Jph1Q9ET80 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Jph1Q9ET80 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Jph1Q9ET80 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Jph1Q9ET80 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Jph1Q9ET80 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Jph1Q9ET80 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Jph1Q9ET80 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Jph1Q9ET80 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Jph1Q9ET80 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Jph1Q9ET80 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Jph1Q9ET80 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Jph1Q9ET80 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Jph1Q9ET80 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Jph1Q9ET80 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Jph1Q9ET80 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Jph1Q9ET80 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Jph1Q9ET80 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Jph1Q9ET80 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Jph1Q9ET80 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Jph1Q9ET80 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Jph1Q9ET80 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Jph1Q9ET80 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Jph1Q9ET80 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Jph1Q9ET80 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Jph1Q9ET80 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Jph1Q9ET80 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Jph1Q9ET80 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Jph1Q9ET80 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Jph1Q9ET80 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Jph1Q9ET80 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Jph1Q9ET80 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Jph1Q9ET80 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Jph1Q9ET80 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Jph1Q9ET80 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Jph1Q9ET80 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Jph1Q9ET80 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Jph1Q9ET80 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Jph1Q9ET80 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Jph1Q9ET80 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Jph1Q9ET80 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Jph1Q9ET80 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Jph1Q9ET80 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Jph1Q9ET80 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Jph1Q9ET80 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Jph1Q9ET80 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Jph1Q9ET80 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Jph1Q9ET80 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Jph1Q9ET80 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Jph1Q9ET80 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Jph1Q9ET80 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Jph1Q9ET80 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Jph1Q9ET80 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Jph1Q9ET80 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Jph1Q9ET80 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Jph1Q9ET80 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Jph1Q9ET80 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Jph1Q9ET80 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Jph1Q9ET80 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Jph1Q9ET80 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Jph1Q9ET80 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Jph1Q9ET80 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Jph1Q9ET80 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms