Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESU6

Brd4, Bromodomain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd4Q9ESU6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Brd4Q9ESU6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Brd4Q9ESU6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Brd4Q9ESU6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Brd4Q9ESU6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Brd4Q9ESU6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Brd4Q9ESU6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Brd4Q9ESU6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Brd4Q9ESU6 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Brd4Q9ESU6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Brd4Q9ESU6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Brd4Q9ESU6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Brd4Q9ESU6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
Brd4Q9ESU6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Brd4Q9ESU6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Brd4Q9ESU6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Brd4Q9ESU6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Brd4Q9ESU6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Brd4Q9ESU6 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Brd4Q9ESU6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Brd4Q9ESU6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Brd4Q9ESU6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Brd4Q9ESU6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Brd4Q9ESU6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Brd4Q9ESU6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.64
Brd4Q9ESU6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Brd4Q9ESU6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Brd4Q9ESU6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Brd4Q9ESU6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
Brd4Q9ESU6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Brd4Q9ESU6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Brd4Q9ESU6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Brd4Q9ESU6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
Brd4Q9ESU6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
Brd4Q9ESU6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Brd4Q9ESU6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Brd4Q9ESU6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Brd4Q9ESU6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Brd4Q9ESU6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Brd4Q9ESU6 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
Brd4Q9ESU6 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Brd4Q9ESU6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Brd4Q9ESU6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Brd4Q9ESU6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
Brd4Q9ESU6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Brd4Q9ESU6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Brd4Q9ESU6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
Brd4Q9ESU6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Brd4Q9ESU6 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Brd4Q9ESU6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
Brd4Q9ESU6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Brd4Q9ESU6 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
Brd4Q9ESU6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Brd4Q9ESU6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Brd4Q9ESU6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Brd4Q9ESU6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Brd4Q9ESU6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Brd4Q9ESU6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Brd4Q9ESU6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Brd4Q9ESU6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Brd4Q9ESU6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Brd4Q9ESU6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Brd4Q9ESU6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Brd4Q9ESU6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Brd4Q9ESU6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Brd4Q9ESU6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Brd4Q9ESU6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Brd4Q9ESU6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Brd4Q9ESU6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Brd4Q9ESU6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Brd4Q9ESU6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
Brd4Q9ESU6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Brd4Q9ESU6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Brd4Q9ESU6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Brd4Q9ESU6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Brd4Q9ESU6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Brd4Q9ESU6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Brd4Q9ESU6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Brd4Q9ESU6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Brd4Q9ESU6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Brd4Q9ESU6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Brd4Q9ESU6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Brd4Q9ESU6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Brd4Q9ESU6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Brd4Q9ESU6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Brd4Q9ESU6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Brd4Q9ESU6 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
Brd4Q9ESU6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Brd4Q9ESU6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Brd4Q9ESU6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
Brd4Q9ESU6 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Brd4Q9ESU6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Brd4Q9ESU6 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Brd4Q9ESU6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Brd4Q9ESU6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Brd4Q9ESU6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Brd4Q9ESU6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
Brd4Q9ESU6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Brd4Q9ESU6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Brd4Q9ESU6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms