Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
Rb1cc1Q9ESK9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Rb1cc1Q9ESK9 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Rb1cc1Q9ESK9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Rb1cc1Q9ESK9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Rb1cc1Q9ESK9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Rb1cc1Q9ESK9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Rb1cc1Q9ESK9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Rb1cc1Q9ESK9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Rb1cc1Q9ESK9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Rb1cc1Q9ESK9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
Rb1cc1Q9ESK9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Rb1cc1Q9ESK9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Rb1cc1Q9ESK9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Rb1cc1Q9ESK9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Rb1cc1Q9ESK9 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Rb1cc1Q9ESK9 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Rb1cc1Q9ESK9 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Rb1cc1Q9ESK9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Rb1cc1Q9ESK9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Rb1cc1Q9ESK9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Rb1cc1Q9ESK9 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Rb1cc1Q9ESK9 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Rb1cc1Q9ESK9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Rb1cc1Q9ESK9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Rb1cc1Q9ESK9 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
Rb1cc1Q9ESK9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Rb1cc1Q9ESK9 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Rb1cc1Q9ESK9 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Rb1cc1Q9ESK9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Rb1cc1Q9ESK9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Rb1cc1Q9ESK9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Rb1cc1Q9ESK9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Rb1cc1Q9ESK9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Rb1cc1Q9ESK9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Rb1cc1Q9ESK9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Rb1cc1Q9ESK9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Rb1cc1Q9ESK9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Rb1cc1Q9ESK9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Rb1cc1Q9ESK9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Rb1cc1Q9ESK9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Rb1cc1Q9ESK9 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Rb1cc1Q9ESK9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Rb1cc1Q9ESK9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Rb1cc1Q9ESK9 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Rb1cc1Q9ESK9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Rb1cc1Q9ESK9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Rb1cc1Q9ESK9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
Rb1cc1Q9ESK9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Rb1cc1Q9ESK9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Rb1cc1Q9ESK9 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Rb1cc1Q9ESK9 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
Rb1cc1Q9ESK9 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Rb1cc1Q9ESK9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Rb1cc1Q9ESK9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Rb1cc1Q9ESK9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Rb1cc1Q9ESK9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Rb1cc1Q9ESK9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Rb1cc1Q9ESK9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Rb1cc1Q9ESK9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Rb1cc1Q9ESK9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Rb1cc1Q9ESK9 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
Rb1cc1Q9ESK9 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Rb1cc1Q9ESK9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Rb1cc1Q9ESK9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Rb1cc1Q9ESK9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Rb1cc1Q9ESK9 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Rb1cc1Q9ESK9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Rb1cc1Q9ESK9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Rb1cc1Q9ESK9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Rb1cc1Q9ESK9 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Rb1cc1Q9ESK9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Rb1cc1Q9ESK9 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Rb1cc1Q9ESK9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Rb1cc1Q9ESK9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Rb1cc1Q9ESK9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Rb1cc1Q9ESK9 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Rb1cc1Q9ESK9 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
Rb1cc1Q9ESK9 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Rb1cc1Q9ESK9 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Rb1cc1Q9ESK9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Rb1cc1Q9ESK9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Rb1cc1Q9ESK9 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Rb1cc1Q9ESK9 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Rb1cc1Q9ESK9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Rb1cc1Q9ESK9 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Rb1cc1Q9ESK9 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
Rb1cc1Q9ESK9 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Rb1cc1Q9ESK9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.97
Rb1cc1Q9ESK9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Rb1cc1Q9ESK9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Rb1cc1Q9ESK9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Rb1cc1Q9ESK9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms