Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD7

Dysf, Dysferlin, mousemouse

Predictions only

Length 2,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DysfQ9ESD7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
DysfQ9ESD7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DysfQ9ESD7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
DysfQ9ESD7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
DysfQ9ESD7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
DysfQ9ESD7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DysfQ9ESD7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DysfQ9ESD7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DysfQ9ESD7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms