Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ube3bQ9ES34 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ube3bQ9ES34 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ube3bQ9ES34 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ube3bQ9ES34 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ube3bQ9ES34 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ube3bQ9ES34 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ube3bQ9ES34 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ube3bQ9ES34 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ube3bQ9ES34 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ube3bQ9ES34 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ube3bQ9ES34 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ube3bQ9ES34 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ube3bQ9ES34 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ube3bQ9ES34 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ube3bQ9ES34 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ube3bQ9ES34 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ube3bQ9ES34 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ube3bQ9ES34 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ube3bQ9ES34 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ube3bQ9ES34 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ube3bQ9ES34 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ube3bQ9ES34 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ube3bQ9ES34 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ube3bQ9ES34 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ube3bQ9ES34 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ube3bQ9ES34 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ube3bQ9ES34 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ube3bQ9ES34 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ube3bQ9ES34 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ube3bQ9ES34 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ube3bQ9ES34 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ube3bQ9ES34 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ube3bQ9ES34 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ube3bQ9ES34 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ube3bQ9ES34 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ube3bQ9ES34 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ube3bQ9ES34 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ube3bQ9ES34 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ube3bQ9ES34 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ube3bQ9ES34 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ube3bQ9ES34 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ube3bQ9ES34 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ube3bQ9ES34 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
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Ube3bQ9ES34 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ube3bQ9ES34 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ube3bQ9ES34 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ube3bQ9ES34 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ube3bQ9ES34 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ube3bQ9ES34 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ube3bQ9ES34 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ube3bQ9ES34 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ube3bQ9ES34 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ube3bQ9ES34 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ube3bQ9ES34 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ube3bQ9ES34 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ube3bQ9ES34 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ube3bQ9ES34 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ube3bQ9ES34 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ube3bQ9ES34 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ube3bQ9ES34 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ube3bQ9ES34 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ube3bQ9ES34 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ube3bQ9ES34 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ube3bQ9ES34 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ube3bQ9ES34 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ube3bQ9ES34 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ube3bQ9ES34 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ube3bQ9ES34 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ube3bQ9ES34 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ube3bQ9ES34 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ube3bQ9ES34 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ube3bQ9ES34 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ube3bQ9ES34 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ube3bQ9ES34 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ube3bQ9ES34 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ube3bQ9ES34 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ube3bQ9ES34 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ube3bQ9ES34 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ube3bQ9ES34 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ube3bQ9ES34 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ube3bQ9ES34 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ube3bQ9ES34 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ube3bQ9ES34 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ube3bQ9ES34 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ube3bQ9ES34 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ube3bQ9ES34 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ube3bQ9ES34 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ube3bQ9ES34 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ube3bQ9ES34 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ube3bQ9ES34 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ube3bQ9ES34 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ube3bQ9ES34 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ube3bQ9ES34 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ube3bQ9ES34 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ube3bQ9ES34 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ube3bQ9ES34 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ube3bQ9ES34 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ube3bQ9ES34 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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