Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP97

Senp3, Sentrin-specific protease 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Senp3Q9EP97 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Senp3Q9EP97 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Senp3Q9EP97 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Senp3Q9EP97 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Senp3Q9EP97 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Senp3Q9EP97 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Senp3Q9EP97 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Senp3Q9EP97 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Senp3Q9EP97 Gm27231-201ENSMUST00000185191 551 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Senp3Q9EP97 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Senp3Q9EP97 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Senp3Q9EP97 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Senp3Q9EP97 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Senp3Q9EP97 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Senp3Q9EP97 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Senp3Q9EP97 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Senp3Q9EP97 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Senp3Q9EP97 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Senp3Q9EP97 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Senp3Q9EP97 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Senp3Q9EP97 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Senp3Q9EP97 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Senp3Q9EP97 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Senp3Q9EP97 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Senp3Q9EP97 2610001A08Rik-201ENSMUST00000193315 867 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Senp3Q9EP97 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Senp3Q9EP97 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Senp3Q9EP97 AC116724.1-201ENSMUST00000227900 972 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Senp3Q9EP97 Snapc5-201ENSMUST00000034965 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Senp3Q9EP97 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Senp3Q9EP97 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Senp3Q9EP97 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Senp3Q9EP97 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Senp3Q9EP97 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Senp3Q9EP97 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Senp3Q9EP97 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Senp3Q9EP97 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Senp3Q9EP97 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Senp3Q9EP97 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Senp3Q9EP97 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Senp3Q9EP97 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Senp3Q9EP97 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Senp3Q9EP97 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Senp3Q9EP97 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Senp3Q9EP97 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Senp3Q9EP97 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Senp3Q9EP97 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Senp3Q9EP97 Olfr1468-ps1-201ENSMUST00000207287 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Senp3Q9EP97 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Senp3Q9EP97 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Senp3Q9EP97 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Senp3Q9EP97 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Senp3Q9EP97 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Senp3Q9EP97 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Senp3Q9EP97 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Senp3Q9EP97 Elk3-204ENSMUST00000151153 1336 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Senp3Q9EP97 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Senp3Q9EP97 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Senp3Q9EP97 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Senp3Q9EP97 Sval2-203ENSMUST00000120605 497 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Senp3Q9EP97 Gm14426-201ENSMUST00000128562 249 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Senp3Q9EP97 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Senp3Q9EP97 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Senp3Q9EP97 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Senp3Q9EP97 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Senp3Q9EP97 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Senp3Q9EP97 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Senp3Q9EP97 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Senp3Q9EP97 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Senp3Q9EP97 Gm38283-201ENSMUST00000193041 695 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Senp3Q9EP97 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Senp3Q9EP97 Vmn1r89-206ENSMUST00000227319 985 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Senp3Q9EP97 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Senp3Q9EP97 Olfr1122-201ENSMUST00000056435 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Senp3Q9EP97 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Senp3Q9EP97 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Senp3Q9EP97 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Senp3Q9EP97 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Senp3Q9EP97 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Senp3Q9EP97 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Senp3Q9EP97 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Senp3Q9EP97 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Senp3Q9EP97 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Senp3Q9EP97 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Senp3Q9EP97 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Senp3Q9EP97 Amelx-204ENSMUST00000112120 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Senp3Q9EP97 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Senp3Q9EP97 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Senp3Q9EP97 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Senp3Q9EP97 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Senp3Q9EP97 Gm18752-202ENSMUST00000193627 587 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Senp3Q9EP97 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Senp3Q9EP97 Olfr1295-201ENSMUST00000207283 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Senp3Q9EP97 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Senp3Q9EP97 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Senp3Q9EP97 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Senp3Q9EP97 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Senp3Q9EP97 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Senp3Q9EP97 Gm21064-201ENSMUST00000189723 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Senp3Q9EP97 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms