Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC69

Ndufa9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa9Q9DC69 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufa9Q9DC69 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufa9Q9DC69 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufa9Q9DC69 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufa9Q9DC69 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufa9Q9DC69 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufa9Q9DC69 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufa9Q9DC69 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufa9Q9DC69 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufa9Q9DC69 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufa9Q9DC69 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufa9Q9DC69 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufa9Q9DC69 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufa9Q9DC69 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufa9Q9DC69 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufa9Q9DC69 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufa9Q9DC69 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufa9Q9DC69 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufa9Q9DC69 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufa9Q9DC69 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufa9Q9DC69 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufa9Q9DC69 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufa9Q9DC69 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufa9Q9DC69 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufa9Q9DC69 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufa9Q9DC69 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufa9Q9DC69 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufa9Q9DC69 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ndufa9Q9DC69 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ndufa9Q9DC69 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ndufa9Q9DC69 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ndufa9Q9DC69 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ndufa9Q9DC69 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ndufa9Q9DC69 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ndufa9Q9DC69 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ndufa9Q9DC69 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ndufa9Q9DC69 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ndufa9Q9DC69 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ndufa9Q9DC69 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufa9Q9DC69 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufa9Q9DC69 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufa9Q9DC69 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufa9Q9DC69 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufa9Q9DC69 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufa9Q9DC69 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufa9Q9DC69 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufa9Q9DC69 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufa9Q9DC69 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufa9Q9DC69 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufa9Q9DC69 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufa9Q9DC69 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufa9Q9DC69 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufa9Q9DC69 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufa9Q9DC69 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufa9Q9DC69 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufa9Q9DC69 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufa9Q9DC69 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufa9Q9DC69 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufa9Q9DC69 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufa9Q9DC69 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufa9Q9DC69 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufa9Q9DC69 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufa9Q9DC69 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufa9Q9DC69 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufa9Q9DC69 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufa9Q9DC69 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufa9Q9DC69 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufa9Q9DC69 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufa9Q9DC69 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufa9Q9DC69 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufa9Q9DC69 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufa9Q9DC69 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufa9Q9DC69 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufa9Q9DC69 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufa9Q9DC69 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufa9Q9DC69 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufa9Q9DC69 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufa9Q9DC69 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufa9Q9DC69 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufa9Q9DC69 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufa9Q9DC69 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufa9Q9DC69 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufa9Q9DC69 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufa9Q9DC69 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufa9Q9DC69 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufa9Q9DC69 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufa9Q9DC69 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufa9Q9DC69 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufa9Q9DC69 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufa9Q9DC69 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufa9Q9DC69 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufa9Q9DC69 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufa9Q9DC69 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufa9Q9DC69 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufa9Q9DC69 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufa9Q9DC69 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufa9Q9DC69 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufa9Q9DC69 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufa9Q9DC69 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufa9Q9DC69 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms