Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smg9Q9DB90 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smg9Q9DB90 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smg9Q9DB90 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smg9Q9DB90 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smg9Q9DB90 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smg9Q9DB90 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Smg9Q9DB90 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smg9Q9DB90 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smg9Q9DB90 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smg9Q9DB90 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smg9Q9DB90 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smg9Q9DB90 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smg9Q9DB90 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smg9Q9DB90 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smg9Q9DB90 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smg9Q9DB90 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smg9Q9DB90 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smg9Q9DB90 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smg9Q9DB90 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smg9Q9DB90 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smg9Q9DB90 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smg9Q9DB90 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smg9Q9DB90 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smg9Q9DB90 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smg9Q9DB90 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smg9Q9DB90 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smg9Q9DB90 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smg9Q9DB90 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smg9Q9DB90 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smg9Q9DB90 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Smg9Q9DB90 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smg9Q9DB90 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smg9Q9DB90 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smg9Q9DB90 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smg9Q9DB90 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smg9Q9DB90 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smg9Q9DB90 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smg9Q9DB90 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smg9Q9DB90 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smg9Q9DB90 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smg9Q9DB90 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Smg9Q9DB90 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smg9Q9DB90 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smg9Q9DB90 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smg9Q9DB90 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smg9Q9DB90 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smg9Q9DB90 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smg9Q9DB90 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smg9Q9DB90 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smg9Q9DB90 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smg9Q9DB90 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smg9Q9DB90 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smg9Q9DB90 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smg9Q9DB90 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smg9Q9DB90 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smg9Q9DB90 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smg9Q9DB90 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smg9Q9DB90 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smg9Q9DB90 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smg9Q9DB90 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smg9Q9DB90 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smg9Q9DB90 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smg9Q9DB90 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smg9Q9DB90 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Smg9Q9DB90 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smg9Q9DB90 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smg9Q9DB90 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Smg9Q9DB90 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smg9Q9DB90 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smg9Q9DB90 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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Smg9Q9DB90 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smg9Q9DB90 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smg9Q9DB90 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Smg9Q9DB90 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smg9Q9DB90 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smg9Q9DB90 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smg9Q9DB90 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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Smg9Q9DB90 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smg9Q9DB90 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Smg9Q9DB90 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Smg9Q9DB90 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smg9Q9DB90 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smg9Q9DB90 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smg9Q9DB90 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smg9Q9DB90 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smg9Q9DB90 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Smg9Q9DB90 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Smg9Q9DB90 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Smg9Q9DB90 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Smg9Q9DB90 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smg9Q9DB90 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smg9Q9DB90 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smg9Q9DB90 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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