Protein–RNA interactions for Protein: Q9D979

Uncharacterized protein C17orf64 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D979 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D979 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D979 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D979 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D979 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D979 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D979 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D979 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D979 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D979 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D979 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D979 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D979 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D979 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D979 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D979 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D979 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D979 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D979 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D979 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D979 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D979 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D979 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D979 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D979 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D979 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D979 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D979 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D979 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D979 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D979 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D979 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D979 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D979 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D979 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D979 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D979 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D979 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D979 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D979 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D979 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D979 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D979 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D979 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D979 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D979 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D979 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D979 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D979 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D979 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D979 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D979 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D979 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D979 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D979 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D979 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D979 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D979 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D979 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D979 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D979 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D979 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D979 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D979 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D979 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D979 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D979 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D979 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D979 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D979 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D979 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D979 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D979 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D979 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D979 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D979 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D979 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D979 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D979 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D979 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D979 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D979 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D979 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D979 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Q9D979 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Q9D979 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D979 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D979 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D979 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D979 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D979 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D979 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D979 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D979 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D979 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D979 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D979 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D979 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D979 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D979 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms