Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Q6

Uncharacterized protein C11orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8Q6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms