Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F3

Slc52a2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a2Q9D8F3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slc52a2Q9D8F3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc52a2Q9D8F3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc52a2Q9D8F3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc52a2Q9D8F3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc52a2Q9D8F3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc52a2Q9D8F3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc52a2Q9D8F3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc52a2Q9D8F3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc52a2Q9D8F3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc52a2Q9D8F3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc52a2Q9D8F3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc52a2Q9D8F3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slc52a2Q9D8F3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slc52a2Q9D8F3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slc52a2Q9D8F3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slc52a2Q9D8F3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slc52a2Q9D8F3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slc52a2Q9D8F3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slc52a2Q9D8F3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slc52a2Q9D8F3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slc52a2Q9D8F3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slc52a2Q9D8F3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slc52a2Q9D8F3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slc52a2Q9D8F3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slc52a2Q9D8F3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slc52a2Q9D8F3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slc52a2Q9D8F3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slc52a2Q9D8F3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slc52a2Q9D8F3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slc52a2Q9D8F3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slc52a2Q9D8F3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slc52a2Q9D8F3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slc52a2Q9D8F3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slc52a2Q9D8F3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slc52a2Q9D8F3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slc52a2Q9D8F3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slc52a2Q9D8F3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slc52a2Q9D8F3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slc52a2Q9D8F3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slc52a2Q9D8F3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slc52a2Q9D8F3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slc52a2Q9D8F3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slc52a2Q9D8F3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slc52a2Q9D8F3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Slc52a2Q9D8F3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Slc52a2Q9D8F3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Slc52a2Q9D8F3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slc52a2Q9D8F3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slc52a2Q9D8F3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slc52a2Q9D8F3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slc52a2Q9D8F3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slc52a2Q9D8F3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slc52a2Q9D8F3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slc52a2Q9D8F3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Slc52a2Q9D8F3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slc52a2Q9D8F3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slc52a2Q9D8F3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slc52a2Q9D8F3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slc52a2Q9D8F3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slc52a2Q9D8F3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slc52a2Q9D8F3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slc52a2Q9D8F3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slc52a2Q9D8F3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slc52a2Q9D8F3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slc52a2Q9D8F3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slc52a2Q9D8F3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slc52a2Q9D8F3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc52a2Q9D8F3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc52a2Q9D8F3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc52a2Q9D8F3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc52a2Q9D8F3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc52a2Q9D8F3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc52a2Q9D8F3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc52a2Q9D8F3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slc52a2Q9D8F3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slc52a2Q9D8F3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slc52a2Q9D8F3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slc52a2Q9D8F3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slc52a2Q9D8F3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slc52a2Q9D8F3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Slc52a2Q9D8F3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slc52a2Q9D8F3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slc52a2Q9D8F3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slc52a2Q9D8F3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Slc52a2Q9D8F3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slc52a2Q9D8F3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slc52a2Q9D8F3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slc52a2Q9D8F3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slc52a2Q9D8F3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slc52a2Q9D8F3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slc52a2Q9D8F3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slc52a2Q9D8F3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Slc52a2Q9D8F3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Slc52a2Q9D8F3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slc52a2Q9D8F3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slc52a2Q9D8F3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slc52a2Q9D8F3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slc52a2Q9D8F3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slc52a2Q9D8F3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms