Protein–RNA interactions for Protein: Q9D658

Ptp4a3, Protein tyrosine phosphatase type IVA 3, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptp4a3Q9D658 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptp4a3Q9D658 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptp4a3Q9D658 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptp4a3Q9D658 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptp4a3Q9D658 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptp4a3Q9D658 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptp4a3Q9D658 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptp4a3Q9D658 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptp4a3Q9D658 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptp4a3Q9D658 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptp4a3Q9D658 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptp4a3Q9D658 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptp4a3Q9D658 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptp4a3Q9D658 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptp4a3Q9D658 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptp4a3Q9D658 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptp4a3Q9D658 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptp4a3Q9D658 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptp4a3Q9D658 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptp4a3Q9D658 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptp4a3Q9D658 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptp4a3Q9D658 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptp4a3Q9D658 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptp4a3Q9D658 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptp4a3Q9D658 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptp4a3Q9D658 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptp4a3Q9D658 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptp4a3Q9D658 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptp4a3Q9D658 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptp4a3Q9D658 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptp4a3Q9D658 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptp4a3Q9D658 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptp4a3Q9D658 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptp4a3Q9D658 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptp4a3Q9D658 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptp4a3Q9D658 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptp4a3Q9D658 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptp4a3Q9D658 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptp4a3Q9D658 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptp4a3Q9D658 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptp4a3Q9D658 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptp4a3Q9D658 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptp4a3Q9D658 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptp4a3Q9D658 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptp4a3Q9D658 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptp4a3Q9D658 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptp4a3Q9D658 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptp4a3Q9D658 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptp4a3Q9D658 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptp4a3Q9D658 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptp4a3Q9D658 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptp4a3Q9D658 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptp4a3Q9D658 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Ptp4a3Q9D658 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptp4a3Q9D658 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptp4a3Q9D658 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptp4a3Q9D658 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptp4a3Q9D658 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Ptp4a3Q9D658 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms