Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V4

Taf1d, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1dQ9D4V4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Taf1dQ9D4V4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Taf1dQ9D4V4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Taf1dQ9D4V4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Taf1dQ9D4V4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Taf1dQ9D4V4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Taf1dQ9D4V4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Taf1dQ9D4V4 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Taf1dQ9D4V4 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Taf1dQ9D4V4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Taf1dQ9D4V4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Taf1dQ9D4V4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Taf1dQ9D4V4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Taf1dQ9D4V4 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Taf1dQ9D4V4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Taf1dQ9D4V4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Taf1dQ9D4V4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Taf1dQ9D4V4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Taf1dQ9D4V4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Taf1dQ9D4V4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Taf1dQ9D4V4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Taf1dQ9D4V4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Taf1dQ9D4V4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Taf1dQ9D4V4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Taf1dQ9D4V4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Taf1dQ9D4V4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Taf1dQ9D4V4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Taf1dQ9D4V4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Taf1dQ9D4V4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Taf1dQ9D4V4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Taf1dQ9D4V4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Taf1dQ9D4V4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Taf1dQ9D4V4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Taf1dQ9D4V4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Taf1dQ9D4V4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Taf1dQ9D4V4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Taf1dQ9D4V4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Taf1dQ9D4V4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Taf1dQ9D4V4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Taf1dQ9D4V4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Taf1dQ9D4V4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Taf1dQ9D4V4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Taf1dQ9D4V4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Taf1dQ9D4V4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Taf1dQ9D4V4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Taf1dQ9D4V4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Taf1dQ9D4V4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Taf1dQ9D4V4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Taf1dQ9D4V4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Taf1dQ9D4V4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Taf1dQ9D4V4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Taf1dQ9D4V4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Taf1dQ9D4V4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Taf1dQ9D4V4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Taf1dQ9D4V4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Taf1dQ9D4V4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Taf1dQ9D4V4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Taf1dQ9D4V4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Taf1dQ9D4V4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Taf1dQ9D4V4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Taf1dQ9D4V4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Taf1dQ9D4V4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Taf1dQ9D4V4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Taf1dQ9D4V4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Taf1dQ9D4V4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Taf1dQ9D4V4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Taf1dQ9D4V4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Taf1dQ9D4V4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Taf1dQ9D4V4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Taf1dQ9D4V4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Taf1dQ9D4V4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Taf1dQ9D4V4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Taf1dQ9D4V4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Taf1dQ9D4V4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Taf1dQ9D4V4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Taf1dQ9D4V4 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Taf1dQ9D4V4 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Taf1dQ9D4V4 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Taf1dQ9D4V4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Taf1dQ9D4V4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Taf1dQ9D4V4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Taf1dQ9D4V4 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Taf1dQ9D4V4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Taf1dQ9D4V4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Taf1dQ9D4V4 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Taf1dQ9D4V4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Taf1dQ9D4V4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Taf1dQ9D4V4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Taf1dQ9D4V4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Taf1dQ9D4V4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Taf1dQ9D4V4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Taf1dQ9D4V4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Taf1dQ9D4V4 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Taf1dQ9D4V4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Taf1dQ9D4V4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Taf1dQ9D4V4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Taf1dQ9D4V4 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Taf1dQ9D4V4 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Taf1dQ9D4V4 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Taf1dQ9D4V4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms