Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms