Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3Z8

4933425L06Rik, RIKEN cDNA 4933425L06, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933425L06RikQ9D3Z8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933425L06RikQ9D3Z8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
4933425L06RikQ9D3Z8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933425L06RikQ9D3Z8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933425L06RikQ9D3Z8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933425L06RikQ9D3Z8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933425L06RikQ9D3Z8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933425L06RikQ9D3Z8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933425L06RikQ9D3Z8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933425L06RikQ9D3Z8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933425L06RikQ9D3Z8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933425L06RikQ9D3Z8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
4933425L06RikQ9D3Z8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933425L06RikQ9D3Z8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933425L06RikQ9D3Z8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933425L06RikQ9D3Z8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
4933425L06RikQ9D3Z8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933425L06RikQ9D3Z8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933425L06RikQ9D3Z8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933425L06RikQ9D3Z8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933425L06RikQ9D3Z8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933425L06RikQ9D3Z8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933425L06RikQ9D3Z8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933425L06RikQ9D3Z8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933425L06RikQ9D3Z8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933425L06RikQ9D3Z8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933425L06RikQ9D3Z8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933425L06RikQ9D3Z8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933425L06RikQ9D3Z8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933425L06RikQ9D3Z8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933425L06RikQ9D3Z8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933425L06RikQ9D3Z8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933425L06RikQ9D3Z8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933425L06RikQ9D3Z8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933425L06RikQ9D3Z8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933425L06RikQ9D3Z8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933425L06RikQ9D3Z8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4933425L06RikQ9D3Z8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4933425L06RikQ9D3Z8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4933425L06RikQ9D3Z8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4933425L06RikQ9D3Z8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4933425L06RikQ9D3Z8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4933425L06RikQ9D3Z8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4933425L06RikQ9D3Z8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4933425L06RikQ9D3Z8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
4933425L06RikQ9D3Z8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
4933425L06RikQ9D3Z8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4933425L06RikQ9D3Z8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4933425L06RikQ9D3Z8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4933425L06RikQ9D3Z8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4933425L06RikQ9D3Z8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4933425L06RikQ9D3Z8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
4933425L06RikQ9D3Z8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
4933425L06RikQ9D3Z8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4933425L06RikQ9D3Z8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4933425L06RikQ9D3Z8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4933425L06RikQ9D3Z8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4933425L06RikQ9D3Z8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4933425L06RikQ9D3Z8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
4933425L06RikQ9D3Z8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4933425L06RikQ9D3Z8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4933425L06RikQ9D3Z8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4933425L06RikQ9D3Z8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4933425L06RikQ9D3Z8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4933425L06RikQ9D3Z8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4933425L06RikQ9D3Z8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4933425L06RikQ9D3Z8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
4933425L06RikQ9D3Z8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
4933425L06RikQ9D3Z8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
4933425L06RikQ9D3Z8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4933425L06RikQ9D3Z8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
4933425L06RikQ9D3Z8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
4933425L06RikQ9D3Z8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
4933425L06RikQ9D3Z8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4933425L06RikQ9D3Z8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4933425L06RikQ9D3Z8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4933425L06RikQ9D3Z8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4933425L06RikQ9D3Z8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
4933425L06RikQ9D3Z8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
4933425L06RikQ9D3Z8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
4933425L06RikQ9D3Z8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4933425L06RikQ9D3Z8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4933425L06RikQ9D3Z8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4933425L06RikQ9D3Z8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
4933425L06RikQ9D3Z8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4933425L06RikQ9D3Z8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
4933425L06RikQ9D3Z8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
4933425L06RikQ9D3Z8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4933425L06RikQ9D3Z8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4933425L06RikQ9D3Z8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
4933425L06RikQ9D3Z8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4933425L06RikQ9D3Z8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4933425L06RikQ9D3Z8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms