Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W4

Gpn3, GPN-loop GTPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpn3Q9D3W4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpn3Q9D3W4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpn3Q9D3W4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpn3Q9D3W4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpn3Q9D3W4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpn3Q9D3W4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpn3Q9D3W4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpn3Q9D3W4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gpn3Q9D3W4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gpn3Q9D3W4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gpn3Q9D3W4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpn3Q9D3W4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpn3Q9D3W4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpn3Q9D3W4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpn3Q9D3W4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpn3Q9D3W4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpn3Q9D3W4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpn3Q9D3W4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpn3Q9D3W4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpn3Q9D3W4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpn3Q9D3W4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpn3Q9D3W4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpn3Q9D3W4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpn3Q9D3W4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpn3Q9D3W4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpn3Q9D3W4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpn3Q9D3W4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpn3Q9D3W4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpn3Q9D3W4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpn3Q9D3W4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpn3Q9D3W4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpn3Q9D3W4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpn3Q9D3W4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpn3Q9D3W4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpn3Q9D3W4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpn3Q9D3W4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpn3Q9D3W4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpn3Q9D3W4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpn3Q9D3W4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpn3Q9D3W4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpn3Q9D3W4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpn3Q9D3W4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpn3Q9D3W4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpn3Q9D3W4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpn3Q9D3W4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpn3Q9D3W4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpn3Q9D3W4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpn3Q9D3W4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpn3Q9D3W4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpn3Q9D3W4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpn3Q9D3W4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpn3Q9D3W4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpn3Q9D3W4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpn3Q9D3W4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpn3Q9D3W4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpn3Q9D3W4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpn3Q9D3W4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpn3Q9D3W4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpn3Q9D3W4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpn3Q9D3W4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpn3Q9D3W4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpn3Q9D3W4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpn3Q9D3W4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpn3Q9D3W4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpn3Q9D3W4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpn3Q9D3W4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpn3Q9D3W4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpn3Q9D3W4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpn3Q9D3W4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpn3Q9D3W4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpn3Q9D3W4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpn3Q9D3W4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpn3Q9D3W4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpn3Q9D3W4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpn3Q9D3W4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpn3Q9D3W4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpn3Q9D3W4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpn3Q9D3W4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpn3Q9D3W4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpn3Q9D3W4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpn3Q9D3W4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpn3Q9D3W4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpn3Q9D3W4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpn3Q9D3W4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpn3Q9D3W4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpn3Q9D3W4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpn3Q9D3W4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpn3Q9D3W4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpn3Q9D3W4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpn3Q9D3W4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpn3Q9D3W4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpn3Q9D3W4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gpn3Q9D3W4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gpn3Q9D3W4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gpn3Q9D3W4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gpn3Q9D3W4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gpn3Q9D3W4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gpn3Q9D3W4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gpn3Q9D3W4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gpn3Q9D3W4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms