Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W1

Rsph14, Radial spoke head 14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph14Q9D3W1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rsph14Q9D3W1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rsph14Q9D3W1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rsph14Q9D3W1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rsph14Q9D3W1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rsph14Q9D3W1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rsph14Q9D3W1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rsph14Q9D3W1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rsph14Q9D3W1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rsph14Q9D3W1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rsph14Q9D3W1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rsph14Q9D3W1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rsph14Q9D3W1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rsph14Q9D3W1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rsph14Q9D3W1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rsph14Q9D3W1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rsph14Q9D3W1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rsph14Q9D3W1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rsph14Q9D3W1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rsph14Q9D3W1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rsph14Q9D3W1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rsph14Q9D3W1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rsph14Q9D3W1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rsph14Q9D3W1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rsph14Q9D3W1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rsph14Q9D3W1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rsph14Q9D3W1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rsph14Q9D3W1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rsph14Q9D3W1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rsph14Q9D3W1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rsph14Q9D3W1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rsph14Q9D3W1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rsph14Q9D3W1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rsph14Q9D3W1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rsph14Q9D3W1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rsph14Q9D3W1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rsph14Q9D3W1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rsph14Q9D3W1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rsph14Q9D3W1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rsph14Q9D3W1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rsph14Q9D3W1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rsph14Q9D3W1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rsph14Q9D3W1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rsph14Q9D3W1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rsph14Q9D3W1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rsph14Q9D3W1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rsph14Q9D3W1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rsph14Q9D3W1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rsph14Q9D3W1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rsph14Q9D3W1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rsph14Q9D3W1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rsph14Q9D3W1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rsph14Q9D3W1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rsph14Q9D3W1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rsph14Q9D3W1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rsph14Q9D3W1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rsph14Q9D3W1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rsph14Q9D3W1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rsph14Q9D3W1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rsph14Q9D3W1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rsph14Q9D3W1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rsph14Q9D3W1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rsph14Q9D3W1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rsph14Q9D3W1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rsph14Q9D3W1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rsph14Q9D3W1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rsph14Q9D3W1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rsph14Q9D3W1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rsph14Q9D3W1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rsph14Q9D3W1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rsph14Q9D3W1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rsph14Q9D3W1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rsph14Q9D3W1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rsph14Q9D3W1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rsph14Q9D3W1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rsph14Q9D3W1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rsph14Q9D3W1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rsph14Q9D3W1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rsph14Q9D3W1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rsph14Q9D3W1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rsph14Q9D3W1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rsph14Q9D3W1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rsph14Q9D3W1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rsph14Q9D3W1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rsph14Q9D3W1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rsph14Q9D3W1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rsph14Q9D3W1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rsph14Q9D3W1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rsph14Q9D3W1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rsph14Q9D3W1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rsph14Q9D3W1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rsph14Q9D3W1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rsph14Q9D3W1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rsph14Q9D3W1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rsph14Q9D3W1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rsph14Q9D3W1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rsph14Q9D3W1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rsph14Q9D3W1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rsph14Q9D3W1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rsph14Q9D3W1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms