Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snx29Q9D3S3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snx29Q9D3S3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snx29Q9D3S3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snx29Q9D3S3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snx29Q9D3S3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Snx29Q9D3S3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Snx29Q9D3S3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snx29Q9D3S3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snx29Q9D3S3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snx29Q9D3S3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snx29Q9D3S3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snx29Q9D3S3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snx29Q9D3S3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snx29Q9D3S3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snx29Q9D3S3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snx29Q9D3S3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snx29Q9D3S3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snx29Q9D3S3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snx29Q9D3S3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Snx29Q9D3S3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snx29Q9D3S3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snx29Q9D3S3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snx29Q9D3S3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snx29Q9D3S3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snx29Q9D3S3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snx29Q9D3S3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snx29Q9D3S3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snx29Q9D3S3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snx29Q9D3S3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snx29Q9D3S3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snx29Q9D3S3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snx29Q9D3S3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snx29Q9D3S3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snx29Q9D3S3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snx29Q9D3S3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snx29Q9D3S3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snx29Q9D3S3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx29Q9D3S3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx29Q9D3S3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx29Q9D3S3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx29Q9D3S3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx29Q9D3S3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx29Q9D3S3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx29Q9D3S3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx29Q9D3S3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx29Q9D3S3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx29Q9D3S3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx29Q9D3S3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx29Q9D3S3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx29Q9D3S3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx29Q9D3S3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx29Q9D3S3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx29Q9D3S3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx29Q9D3S3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx29Q9D3S3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx29Q9D3S3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx29Q9D3S3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx29Q9D3S3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx29Q9D3S3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx29Q9D3S3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx29Q9D3S3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx29Q9D3S3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx29Q9D3S3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx29Q9D3S3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx29Q9D3S3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx29Q9D3S3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx29Q9D3S3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx29Q9D3S3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx29Q9D3S3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx29Q9D3S3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx29Q9D3S3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx29Q9D3S3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx29Q9D3S3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx29Q9D3S3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx29Q9D3S3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx29Q9D3S3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx29Q9D3S3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx29Q9D3S3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx29Q9D3S3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx29Q9D3S3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx29Q9D3S3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx29Q9D3S3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx29Q9D3S3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx29Q9D3S3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx29Q9D3S3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx29Q9D3S3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx29Q9D3S3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx29Q9D3S3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx29Q9D3S3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx29Q9D3S3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx29Q9D3S3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx29Q9D3S3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx29Q9D3S3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx29Q9D3S3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx29Q9D3S3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx29Q9D3S3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx29Q9D3S3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx29Q9D3S3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx29Q9D3S3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms